Французы вошли в Неаполь 22 февраля 1495 г. Однако легкость, с какой Карл VIII добился своей цели, испугала европейских монархов. Была сформирована широкая антифранцузская коалиция (Священная лига), в которую вошли, кроме папы и Испании, Максимилиан Габсбург, Венеция и Милан. Карл понял, что ветер переменился, и, как только испанцы высадились в Калабрии, поспешил оставить Апеннинский полуостров, но по пути был настигнут союзной армией под командованием Франческо II Гонзаги. В битве при Форново (6 июля 1495 г.) французы были разбиты, но самому Карлу удалось уйти во Францию. Неаполитанский трон снова занял Фердинанд II Арагонский.
Карл VIII умер в 1498 г., не оставив наследников. На престол вступил Людовик XII Орлеанский, первой целью которого стало изгнание из Милана Лудовико Моро и передача власти законным наследникам династии Висконти. Александр VI, увидев шанс на герцогскую корону для своего сына Чезаре, вступил в союз с Людовиком. В целях укрепления союза король предложил в жены Чезаре принцессу Шарлотту д’Альбре, сестру короля Наварры, дав ей в приданое маленькое герцогство Валентинуа на юге Франции. Людовик пообещал также оказать Чезаре поддержку в борьбе за северную итальянскую область Романья, после чего вторгся в пределы Италии и захватил с помощью швейцарских наемников Милан.
У папы тем временем появились проблемы на другом фронте. С резкой критикой пороков «церковных генералов» выступил доминиканский монах Савонарола. Борьба с проповедником стоила понтификам немалой крови. Наконец папе удалось добиться осуждения своего то ли противника, то ли союзника (ведь Савонарола призывал к очищению церкви от мирской грязи). Обвиненный в ереси, Савонарола был сожжен на костре в мае 1498 г. на площади Синьории во Флоренции.
В 1500–1503 гг. Чезаре Борджа проводит несколько победных компаний в Романье. Французский король оказывает ему моральную поддержку, но деньги герцог Валентинуа получает из папской казны, а чтобы пополнить ее, понтифик вынужден продавать кардинальские звания. (Всего за 11 лет своего пребывания во главе церковной иерархии Александр VI назначил 43 новых кардинала.)
Один за другим сдавались города Романьи, и среди сложивших оружие были города, формально принадлежавшие Папской области. Иными словами, церковь потеряла немалую часть своей территории, уступив ее захватчикам Борджа, которые поставили перед собой высокую цель: создать на севере Италии мощное светское государство и утвердить там собственную династию. А для этой цели надо было прежде всего устранить соперников из числа римских нобилей. Отсюда – интриги и преследование таких аристократических родов, как Савелли, Каэтани, Колонна; отсюда – конфискации их владений, которые обычно оказывались в руках семейства Борджа. Понтифик уже поглядывал жадными глазами на Тоскану, но для ее завоевания нужны были деньги, много денег. А где их взять? И вот папа обращается к испытанному средству: продаже церковных должностей.
Смерть понтифика до сих пор вызывает сомнения. Официальная версия гласит, что Александр VI умер от малярии. Но есть и другая версия. В ней говорится, что папа был отравлен. Разумеется, по ошибке. Есть свидетельства, что тело понтифика сильно раздулось, язык был лиловым, а эти признаки свидетельствуют о сильном отравлении. Говорят, что во время застолья с кардиналом Адриано Кастеллези понтифик случайно выпил бокал вина с ядом, предназначенным для кардинала. Это же вино пригубил и Чезаре Борджа, но он не умер, хотя и тяжело болел. Другие источники утверждают, что симптомы отравления были и у Кастеллези, и у многих слуг, так что речь идет о массовом пищевом отравлении.
Смерть Александра VI положила конец честолюбивым замыслам Чезаре Борджа. Армию ему содержать было не на что. В конце концов Чезаре был арестован генералом Гонсальво де Кордобой; пленника отвезли в Испанию; Чезаре бежал из тюрьмы и погиб в 1507 г., защищаясь от наемных убийц.
В области изобразительного искусства Александр VI отличался изысканным вкусом, обожал декоративность, перегруженность деталями, многофигурность – все названные признаки характерны для каталонского искусства. Его любимым художником, как уже сказано, был Пинтуриккьо, а одним из обожаемых им скульпторов – молодой Микеланджело.
Гениальный мастер прибыл в Рим в 1496 г. по приглашению кардинала Раффаэле Риарио. Современники утверждали, что юный ваятель пытался продать созданного им «Купидона» как античную статую. Кардинал обнаружил обман, но пожелал познакомиться с подающим большие надежды скульптором и даже заказал ему «Вакха».
В 1498 г. кардинал Жан де Бильер передает скульптору новый заказ на сюжет оплакивания Христа (знаменитая «Пьета ватиканская», 1499 г.).