С переходом Гражданской войны в России в заключительную фазу появилась реальная возможность советизации важного региона бывшей Российской империи – Туркестана (Средней Азии). На повестке дня командования Туркестанского фронта стояла ликвидация суверенного Бухарского эмирата, выступавшего в то время центром контрреволюции в Туркестане и представлявшего реальную угрозу для войск советского Закаспийского фронта и его Петро-Александровской группы.
В начале лета 1920 г. руководство РККА приступило к разработке плана проведения Бухарской операции. Ее целью являлось свержение неугодного для Советской России правителя (эмира Сейид Алим-хана) и установление с помощью местных пророссийских сил на территории эмирата советской власти. К этому временем отношения между РСФСР и Бухарой заметно ухудшились. Захват в одностороннем порядке красноармейцами ряда правительственных зданий в Новой Бухаре (русском поселке) заставило эмира 7 июля призвать своих подданных к «священной войне против неверных» во имя «защиты ислама и шариата»347.
Командование фронта рассчитывало «управиться» с Бухарой в течение суток, захватив в плен эмира и его правительство. Одновременно рассматривалось несколько вариантов проведения операции: двинуть на Бухару войска Туркфронта неожиданно для Сейид Алим-хана или предварительно организовать восстание в эмирате, используя его как предлог для вмешательства Красной Армии348.
В процессе подготовки операции большое внимание обращалось на усиление воздушной группировки советских войск в Средней Азии. В июле 1920 г. на оборудованном у ст. Каган (12 км от г. Бухары) полевом аэродроме были сосредоточены 11-й, 25-й и 43-й авиаотряды349, то есть до 60 % всех воздушных сил фронта350.
12 августа командующий войсками Туркестанского фронта М.В. Фрунзе подписал директиву (№ 3504), предписывавшую начальнику ВФ фронта «к 6 часам 17 августа сосредоточить в районе Новой Бухары все наличные боевые самолеты 25, 26 и 43-го авиаотрядов, где действовать согласно указаниям командующего Бухаро-Самаркандской группой351»352.
Последние были объединены в специальную авиационную группу (10–12 самолетов) под руководством начальника ВФ Туркфронта В.Ю. Юнгмейстера. Из вышеотмеченных авиаотрядов лишь 43 ао располагался в Новой Бухаре, 25-й находился в г. Чарджоу, а 26-й – в г. Самарканде. Также к операции привлекался 13-й воздухоплавательный отряд353.
Оценивая высокую вероятность начала военного противостояния с частями РККА, Сейид Алим-хан объявил в эмирате всеобщую мобилизацию. Это позволило к концу августа 1920 г. создать дееспособную армию, которая вместе с иррегулярными войсками областных правителей (беков) насчитывала до 43 тыс. штыков и сабель, 55 орудий и 18 пулеметов354.
Командование Туркестанского фронта постоянно получало информацию о военных приготовлениях будущего противника, в том числе за счет разведывательных полетов нашей авиации в районе Бухары.
28 августа узбекские коммунисты подняли в эмирате восстание, создали Временный революционный комитет и обратились к правительству РСФСР с просьбой о военной помощи. Ожидая подобный сценарий событий, командованием Туркфронта заранее была сформирована Самаркандско-Бу-харско-Чарджуйская группа советских войск (9,5 тыс. штыков и сабель, 40 орудий, 230 пулеметов, И (по другим сведениям – 12) самолетов, 5 бронепоездов и 10 бронеавтомобилей; командующий – Д.Е. Коновалов). Оперативно ей подчинялся Амударьинский отряд Аральской военной флотилии (4 вооруженных парохода, 2 катера, несколько вспомогательных судов), базировавшейся на Чарджуй355.
По плану, разработанному командованием фронта, группа частью сил должна была изолировать отряды беков, а главными силами (Каганская группа войск) во взаимодействии с повстанцами (около 5 тыс. человек) наступать на Старую Бухару, представлявшую собой хорошо укрепленную крепость (глинобитные стены пятиметровой толщины имели высоту до 10 м).