Мария уже не та невинная девочка, которая весело маршировала с саблей в руках, в то время как ее отец заключал трудный и позорный мир. Теперь она стала частью взрослой жизни, и эта жизнь вовсе не так красива и заманчива, как, возможно, ей представлялось в детстве. В апреле 1865 года в Ницце умер от туберкулеза брат Марии, Николай Александрович. Ему исполнился только двадцать один год. Разумеется, это было большим горем для семьи.
Но невзгоды на этом не кончились. На Александра объявили охоту террористы-радикалы, недовольные тем, что реформы идут слишком медленно и остаются половинчатыми. В частности, особенно их возмутило то, что крестьян отпускали без земельных наделов, достаточных для того, чтобы прокормить семью, и тем приходилось либо выкупать недостающую землю у помещиков, либо отрабатывать ее в качестве временнообязанных. На императора было совершено два покушения. 4 апреля 1866 года на прогулке в Летнем саду в него стрелял Дмитрий Каракозов. Рассказывали, что император, оставшийся невредимым, сразу же захотел увидеть нападавшего, и когда к нему подвели Каракозова, тот сказал, объясняя свой поступок: «Ваше величество, вы обидели крестьян». На следствии оказалось, что покушавшийся был не одиночкой, а членом террористической организации, придумавшей себе весьма мелодраматическое название «Ад» (возможно, это была аббревиатура, означавшая «активные действия»). Во второй раз в императора стреляли 25 мая 1867 года, когда он прогуливался в Булонском лесу с императором Наполеоном III. По легенде, после покушения Наполеон сказал Александру: «Если это был итальянец — значит, покушались на меня, если поляк — на вас». Стрелок оказался поляком — Антоном Березовским, который заявил на следствии: «Я сознаюсь, что выстрелил сегодня в императора во время его возвращения со смотра, две недели тому назад у меня родилась мысль цареубийства, впрочем, вернее, я питал эту мысль с тех пор, как начал себя сознавать, имея в виду освобождение родины».
Александр не изменил своей привычке гулять в Летнем саду, куда по-прежнему свободно допускалась публика, и запретил своим охранникам подходить к себе ближе ста метров. Все находили, что он поступает очень мужественно. Но вскоре по Петербургу поползли слухи, будто эта храбрость связана с тем, что император тайно встречается с графиней Екатериной Долгоруковой. Неизвестно, когда именно об этом узнала великая княжна и сколько ей было известно, но она не могла не видеть, что отношения между ее отцом и тяжело болевшей матерью уже не те, что были раньше.
После смерти Марии Александровны в 1880 году, не дожидаясь истечения годичного траура, Александр II заключил морганатический брак с княжной Долгоруковой, получившей титул светлейшей княгини Юрьевской, и признал рожденных ею до брака детей: сыновей Григория и Бориса и двух дочерей, Ольгу и Екатерину. Позже Мария Александровна признавалась своей бывшей воспитательница Анне Тютчевой: «Вы понимаете, что Россия для меня была закрыта навсегда. Впрочем, я просила своего мужа и всех близких мне людей никогда не касаться со мной этого вопроса, так что до кончины государя я никогда не имела никаких подробностей относительно его новых семейных обстоятельств».
В Британии молодую супругу принца Альфреда тоже ждали неприятности. Правда, на этот раз меньшего масштаба: всего лишь неприязнь свекрови и споры из-за титула.
Император Александр II настаивал, чтобы на ее новой родине к Марии Александровне обращались «Ваше Императорское Высочество». Королева же требовала, чтобы герцогиня Эдинбургская удовлетворилась титулом «Ваше Королевское Высочество». В итоге обе стороны пошли на уступки: Мария титуловалась как «Ее Королевское Высочество», «Ее Королевское и Императорское Высочество», и «Ее Императорское и Королевское Высочество», а королева Виктория дала ей первое место после принцессы Уэльской.
В течение последующих четырех лет в семье сына королевы Виктории родились три девочки: Мария, Виктория и Александра. В 1884 году герцогиня Эдинбургская родила еще одну дочь — Беатрис.
В России по-прежнему было неспокойно. После небольшой паузы покушения на императора возобновились: 2 апреля 1879 года в него стрелял участник общества «Земля и воля» Александр Соловьев; 19 ноября 1879 года террористы попытались подорвать поезд, на котором ехали император и члены его семьи; 5 февраля 1880 года Степан Халтурин, устроившийся на работу во дворец, организовал взрыв в столовой, где должен был обедать император. Александра и его сотрапезников спасло лишь то, что распорядок их дня изменили из-за случайности. Мария Александровна могла сколько угодно сердиться на отца, но она не могла не беспокоиться за него и за братьев.