В 1939 году Мария вышла на пенсию. Вскоре, по благословениям вырицкого старца и митрополита Алексия (Симанского), она оставляет свою квартиру на Литейном проспекте и переходит на жительство при Николо-Богоявленском кафедральном соборе. Здесь трудница Христова несет различные послушания и всецело отдает себя молитве. Когда город покрыла блокадная ночь, Мария проявила необыкновенную бодрость духа, постоянно утешая и ободряя многих людей. Во время артиллерийских обстрелов и воздушных налетов она слезно молилась великому угоднику Божиему Николаю Чудотворцу об избавлении города и России от вражеского нашествия. Несмотря на голодную слабость и воздушные тревоги, постоянно ходила Мария на Смоленское кладбище и приносила свои горячие молитвы блаженной матери нашей Ксении.
Все годы войны Мария провела рядом с владыкой Алексием (Симанским), который жил в ту грозную пору в Никольском соборе. Будущий Патриарх почитал ее высоко духовную жизнь, порою спрашивал ее совета. После кончины Патриарха Сергия митрополит стал Патриаршим Местоблюстителем и переехал в Москву, а Марию благословил остаться в соборе.
Посвящая дни неустанным трудам во славу Божию, ночи она отдавала молитве. При малейшей возможности приезжала в Вырицу, чтобы из источника благодати почерпнуть новых сил и духовного опыта. Батюшка Серафим очень радовался за свою воспитанницу и видел, как восходит она от силы в силу. Только он мог всецело понять внутреннюю жизнь праведницы и дать мудрые наставления, необходимые для неуклонного духовного роста. Мария преклонялась перед вырицким подвижником и до конца дней своих почитала его святым богодухновенным старцем. Она следовала всем его назиданиям и советам. Через батюшку научилась Мария желать спасения всем людям, а по неустанным трудам своим, обрела и благодатный мир о Христе Иисусе Господе нашем. Перед кончиной отец Серафим Вырицкий благословил многих духовных детей обращаться к матушке Марии за советом и молитвенной помощью.
Постоянно пребывая в недоступных для постороннего взора покаянии, сокрушении сердца и умной молитве, старица Мария уже не могла скрывать свое духовное состояние от истинно верующих людей. Одного взгляда на нее было достаточно, чтобы понять – этот человек не от мира сего. Любовь светилась в каждом ее слове и деле. Люди тянулись к ней, на любовь отвечая любовью.
Прихожане приносили ей много подарков, гостинцев, денег, и она тут же раздавала все, без остатка, самым нуждающимся, как бы перераспределяя полученное. Сам Господь указывал матушке, кому необходима такая помощь.
Вновь и вновь видели люди, как в зной и лютое ненастье, летом и зимою быстрой походкой шагала она в легких тапочках на Смоленку. Блаженная шла к Блаженной, чтобы просить за неразумных и заблудших детей. Матушка Мария часто научала нас: «Идите ко Ксении Блаженной, только пешком, читая "Отче наш…" и "Богородице Дево…"»
Многие ощущали на себе силу молитв старицы Марии. Матушка обрела неизменную любовь всех верующих и священства города. Люди приходили к ней, чтобы разрешить самые сложные вопросы духовной жизни. 17 апреля 1962 года, по благословению Святейшего Патриарха Алексия I, в Псково-Печерской обители, она приняла великую схиму. Было это ровно на третий день после дня памяти преподобной Марии Египетской, как и предсказал ей отец Варнава. Постригал мать Марию, ныне приснопамятный старец, схиигумен Савва (Остапенко).
Более всего поражал всех светлый лик матушки. Голос у нее был тихий и мягкий. Она всегда улыбалась и была очень немногословна. Всегда с трепетным благоговением вспоминала она отца Серафима. Видно было, что для нее всякая мысль о нем – молитва.
Схимонахиня Мария рассказывала мне, как святой преподобный Варнава Гефсиманский благословил на брак Ольгу и Василия Муравьевых. Впоследствии он благословил их принять монашеский постриг, когда Россию постигнут тяжкие испытания. Матушка восхищалась подвигами вырицкого старца и говорила: «Какую он прожил жизнь! Скольким людям помог!»
Всегда и во всем старалась она подражать батюшке Серафиму. Ее духовное влияние простиралось далеко за пределы города святого апостола Петра. Промыслом Божиим, старицу Марию знали и почитали многие государственные деятели. Когда, в начале 60-х годов, на Церковь обрушились хрущевские гонения, был арестован и незаслуженно осужден архиепископ Черниговский Андрей (Сухенко). Матушка очень сокрушалась по этому поводу. Она послала Председателю Верховного суда Александру Федоровичу Горкину коробку конфет и просила передать со словами: «Бабушка Мария просит освободить архиепископа Черниговского». И что вы думаете? Был назначен пересмотр дела и владыку Андрея освободили досрочно…