Родился отец Алексий 30 сентября 1882 года в селе Всехсвятское Слободского уезда, Вятской губернии, в семье сельского священника. От юности своей получал он уроки самоотверженного служения Богу и ближним. С детских лет помогал по храму и принимал участие в делах милосердия. Служил алтарником, псаломщиком, учился в Вятской Духовной семинарии. В 1902 году связал свою судьбу с Фаиной Сергеевной Сырневой, дочерью священника, которая в течение многих лет делила с батюшкой все жизненные невзгоды и редкие радости. В 1903 году закончил семинарию, был рукоположен в сан иерея и до 26 лет служил и законоучительствовал в Вятской губернии. Господь даровал отцу Алексию двух сыновей: в 1907 году родился Сергей, в 1910 – Василий.
В 1908 году успешно поступил в Санкт-Петербургскую Духовную Академию и в 1912 году блестяще окончил ее со степенью кандидата богословия. Его сочинение на тему «1812 год и его последствия для Православной Церкви и православного духовенства» получило высокую оценку профессоров и преподавателей Академии [205].
При необычных обстоятельствах иерей Алексий Кибардин оказался одним из приписных священников Феодоровского Государева собора. Община сестер милосердия во имя Христа Спасителя, куда он был определен после окончания Духовной Академии, находилась под Августейшим покровительством Государыни Императрицы Александры Феодоровны. Царственная благодетельница общины неоднократно бывала на богослужениях в храме святой Марии Магдалины на Сергиевской улице, где служил отец Алексий. До самозабвения, умом и сердцем воспаряя к горнему, совершал он священнодействие. Чуткое сердце благочестивейшей Императрицы немедленно оценило нелицемерное усердие молодого священника. 21 июня 1913 года его перевели в Феодоровский Государев собор.
Собор имел особый статус – он был приходом Августейшей Семьи и чинов Собственного Его Императорского Величества Сводного пехотного полка и Собственного Его Величества Конвоя, размещавшихся в Царском Селе.
С началом Первой мировой войны при Феодоровском Государевом соборе был открыт лазарет для раненых воинов. Шефство над ним взяли Великие Княжны Мария Николаевна и Анастасия Николаевна. Августейшие покровительницы лазарета сами работали здесь в качестве сестер милосердия, помогая медикам и раненым. Операции и перевязки шли круглосуточно. Многие раненые погибали от потери крови, гангрены и других осложнений. К обязанностям полкового священника Императорского Конвоя у отца Алексия прибавилось новое многотрудное послушание – пастырское служение в переполненных ранеными лазаретах.
Священство собора не имело времени для отдыха ни днем, ни ночью: безконечно было число исповедников, многие из которых не знали, доживут ли до следующего дня. Они уповали на Бога больше, чем на врачей. Здесь надо было проявлять необыкновенную чуткость и осторожность, чтобы недугующие не теряли надежды на спасение в этой жизни и в будущей. В соборе непрестанные панихиды чередовались с молебнами о даровании победы российскому воинству, об избавлении от неволи томящихся в плену.