В апреле 1912 года в ряде российских газет появилась информация, утверждающая, что Мясоедов является германским шпионом. Инициатором разоблачительной кампании становятся депутат Государственной думы А. И. Гучков и редактор газеты «Новое время» А. С. Суворин. Официальное служебное расследование действительно подтвердило подозрительную деятельность Мясоедова, однако в этот раз он легко отделался от наказания с помощью дружеской защиты генерала Сухомлинова, но все же его отстранили от работы и вновь разжаловали. Однако с началом Первой мировой войны, в 1914 году, к удивлению всех, по распоряжению самого военного министра Сухомлинова Мясоедов внезапно производится в полковники и зачисляется в штаб 10-й армии, где руководит разведкой, контрразведкой и активно снабжает германское командование ценной военной оперативной информацией. Пользуясь своим ответственным служебным положением, полковник Мясоедов через свою жену передал противнику важные секретные документы – оперативные карты с подробностями расположения русских воинских подразделений 10-й армии. За эту «операцию» он получил благодарность немецкого командования и денежный гонорар в размере 30 тысяч рублей. Пойманный с поличным и арестованный жандармский полковник, несмотря на веские улики его преступной деятельности, на допросах полностью отрицал предъявленные ему обвинения в шпионаже. Но, на его беду, из германского плена «бежал» подпоручик Колаковский, завербованный немецкой разведкой и засланный для совершения в русском тылу целого ряда диверсий. Перед забросом в русский тыл завербованный немецкий агент имел указание при необходимости обращаться за помощью к… полковнику Мясоедову, но при своем задержании дал в русской контрразведке добровольное признательное показание и полностью охарактеризовал преступную деятельность полковника Мясоедова. Наконец-то в деле германского агента поставили точку. 18 марта 1915 года Мясоедов был повешен в Александровской цитадели. Разразился грандиозный скандал, в котором главным фигурантом проходил покровитель германских агентов и главный резидент немецкой разведки – российский военный министр генерал-адъютант Сухомлинов, препровожденный сначала под домашний арест с подпиской о невыезде, а затем, в декабре 1916 года, заключенный в Трубецкой бастион Петропавловской крепости. Однако усилиями императрицы Александры Федоровны «бедняга» Сухомлинов вскоре «по состоянию здоровья» был переведен в нервную клинику, а из нее затем милостиво отпущен домой.
С позором отставленный от должности генерал В. А. Сухомлинов освобождает казенные апартаменты на набережной Мойки и вместе с семьей переселяется в арендуемую квартиру доходного дома в районе Коломны, на Офицерской улице, 53.
После Февральской революции Сухомлинов был вновь арестован и предан суду Временного правительства по обвинению в измене, в бездействии, во взяточничестве и приговорен судом к пожизненной каторге. В деле бывшего военного министра фигурировали шесть томов документов, хранящихся в канцелярии Верховной следственной комиссии, полностью обличающих заключенного в предъявленных ему обвинениях. Суд проходил в период с 10 августа по 12 сентября 1917 года. Председательствующим суда являлся сенатор Н. Н. Таганцев, обвинителем – В. П. Носович, а защитником – М. Г. Казаринов. В качестве соучастницы к суду привлекалась и жена генерала Сухомлинова. Петроградские газеты тогда писали, что большинство предъявленных обвинений бывшему военному министру Российской империи на суде не подтвердились, однако генерала все же признали виновным в «недостаточной подготовке армии к войне». 20 сентября 1917 года генерала приговорили к бессрочной каторге, к лишению всех прав и состояния, его супругу суд тогда оправдал. После апелляции адвокатом приговора пожизненная каторга В. А. Сухомлинову была заменена тюремным заключением его в Трубецком бастионе Петропавловской крепости Петрограда. После Октябрьского государственного переворота 1917 года заключенного Сухомлинова перевели в городскую тюрьму «Кресты». 1 мая 1918 года генерал, достигший 70-летнего возраста, был амнистирован советским правительством, освобожден из заключения и выехал с семьей в Финляндию, из которой затем переехал в Германию. В эмиграции он опубликовал книгу «Воспоминания», в ней он попытался представить себя в роли «ангела миротворца», выступающего за сердечную дружбу двух стран – России и Германии. Жизнь в эмиграции была полна злоключений. Генерал бедствовал, голодал и умер в 1926 году.