Примерно 13.12.1699 по приказу Пенна был арестован Роберт Брейденхэм (Bradenham), врач капитана Кидда. 23.12.1699 Пенн и Совет издали прокламацию против пиратства (and other marauders of the sea), где призывали всех жителей колонии помочь в выправлении ситуации. Должностным лицам было предписано арестовывать всех подозреваемых в пиратстве; привлекать к ответственности всех, кто оказывал пиратам помощь и предоставлял убежище; всех же призывали следить за действиями хозяев таверн и гостиниц. Прокламация содержала своеобразную «методичку»: как распознавать пиратов. Награда в 10 ф. ст. была обещана за любую информацию, доказывающую вину заподозренных в пиратстве708
.28.01.1700 в Филадельфии родился Джон Пенн (1700–1746) – единственный ребёнок У. Пенна, ставший уроженцем Америки, впоследствии губернатор колонии.
В январе 1700 г. Пенн назначил выборы Генеральной ассамблеи на основе Маркхэмовой Формы правления709
. Они прошли и в графстве Ньюкасл. С его приездом сепаратистские настроения в Делавэре, казалось, пошли на спад.25.01.1700 собралась первая после приезда Пенна Генеральная ассамблея. В порядке выполнения требований Лондона, был принят закон о запрете торговли с Мадагаскаром и Наталем (Natoll – никто не знал, где это, и что правильно пишется «Natal»). Обе палаты приняли декларацию о невиновности народа Пенсильвании в пиратских деяниях. Да, Пенсильвания за последние годы обогатилась, но причиною вовсе не незаконная торговля, а «наше трудолюбие» и то Божье благословение, какое всегда простирается на честные начинания и труды. Ассамблея даже высказала сожаление, что другие колонии не следуют твёрдо тем же путём.
5 января 1700 г. Роберт Тёрнер, Гриффит Джонс, Фрэнсис Рол, Джозеф Уилкокс направили Пенну письмо, убеждая его отменить Маркхэмову Форму правления. Они настаивали, чтобы очередные выборы были проведены на основании Хартии свобод 1682 г., с тем чтобы избранному таким образом составу делегатов Пенн поручил и пересмотр конституции710
. Письмо это было прочитано в Совете.25 января – 10 февраля 1700 г. Совет, Ассамблея и губернатор Пенн обсудили проблему ещё раз, и в итоге Пенн назначил на 10.03.1700 выборы советников и членов Ассамблеи на основании норм Формы правления Пенсильвании и Делавэра 1683 г. Ассамблея, избранная на основании Маркхэмовой Формы правления, в это время ещё заседала.
06.03.1700 Р. Кварри писал Коллегии торговли, что Пенн честно и усердно сотрудничает с Адмиралтейским судом во всём, что связано с интересами короны, и даже высказал надежду, что прежних жалоб на пенсильванцев ему уже никогда не придётся повторять711
.Однако вскоре Пенн убедился, что во многих случаях, когда пенсильванцы противодействуют суду, резоны для этого у них есть. Уже 28.04.1700 Пенн довёл до сведения Коллегии, что, по мнению пенсильванцев – и по его мнению, – этот суд нередко действует вразрез с нормами общего права. Так, суд пытался запретить производство некоторых товаров в десятках миль от побережья: Пенн обращал внимание Коллегии, что в других колониях – Нью-Йорке, Мэриленде, Массачусетсе – этот суд таких географически широких полномочий не имеет. Одновременно Пенн сообщил Коллегии торговли, что Дэвид Ллойд смещён с должностей генерального атторнея и секретаря судов графства Филадельфия712
. Возможно, именно этот эпизод сделал его хроническим противником Пенна на все оставшиеся годы жизни последнего (хотя об этом историки спорят)713. Лорды Торговли рассмотрели поступившие его доклады 26 июля и в письме Пенну 23.08.1700 одобрили его действия714.30.03.1700 в Филадельфию начали прибывать члены нового Совета. В понедельник 01.04.1700 собралось 15 чел. Пенн заявил им, что как законы, так и практика их исполнения нуждаются в корректировках. Спешить с этим не надо, но постепенный и вдумчивый пересмотр законов необходим. Лучше немного чётко исполняемых законов, чем много, но игнорируемых. Он вспомнил и квакерские мечты об упразднении государства вообще и заявил, что, реальны такие мечты или нет, государство во всяком случае не самоцель, а средство обеспечения благополучия колонии. Пенн призвал отказаться от политических интриг, разделения на партии, а тем более фракции и клики. Негоже и впутывать религию в политику715
.В ответ один из членов Совета заявил, что народу нужна новая хартия. Пенн спросил собравшихся: как они считают, чтó сейчас действует: Хартия свобод или Маркхэмова Форма правления? Тот же советник ответил: действует лучшая часть старой Хартии, пока мы не напишем новую. Пенн ответил: «“Акт о поселении” действовал, пока я не прибыл. Теперь я прибыл. Мой собственный акт не может связывать меня». Пенн предложил Совету заняться пересмотром законов, с тем чтобы представить Ассамблее их новые варианты для утверждения.