Султан Махмуд II, надеявшийся укрепить империю, проводя политику централизации, сделал первую попытку изгнать мамлюков из Багдада в 1810 году. Имперские войска свергли и убили Сулеймана, но не смогли поддержать порядок. Порте снова пришлось признать власть мамлюков. После ожесточенной фракционной борьбы выбор пал на Дауд-пашу, который стал последним мамлюкским правителем Багдада. Дауд-паша родился в христианской семье в Грузии и был продан в возрасте тринадцати лет. Он был неразборчив в средствах, но завоевал репутацию благочестием и исламской ученостью. Его двор был всегда пышным и помпезным.
Помимо обычных проблем с арабскими племенами и внутренними разногласиями среди мамлюков, Дауд-паша оказался втянутым в более серьезную борьбу с курдами и войну с Ираном. Иранцы в 1808 году снова предъявили претензии на Шахразур, когда Абд ар-Рахман-паша Бабан, потерпев поражение от противника, который пользовался поддержкой мамлюков, бежал в Тегеран и заключил союз с Фатх Али-шахом. И хотя Порта впоследствии восстановила Абд ар-Рахмана, каджарское правительство считало Бабанов иранскими вассалами. В 1818 году, когда противники Бабанов получили поддержку Дауд-паши и каджарского правителя Кирманшаха Мухаммеда Али Мирзы, последний вторгся в Ирак и разгромил силы мамлюков. После этого иранские войска остались в Сулеймании. Хотя Фатх Алишах не планировал отвоевывать Ирак, иранцы сильно переживали из-за разграбления Кербелы и знали, что, когда Махмуд II начал кампанию против полунезависимых
Некоторое время внимание Махмуда II отвлекали от Ирака и Курдистана более важные вопросы. После истребления янычар в Стамбуле в 1826 году Дауд-паша, повинуясь указаниям Порты, распустил местных янычар, после чего попытался модернизировать свои местные силы с помощью французского инструктора и британского оружия. Существование автономного режима в Ираке вызвало большое беспокойство в Стамбуле, когда Мухаммед Али-паша из Египта выдвинул претензии на Сирию. В 1830 году султан объявил о смещении Дауд-паши. Эмиссар, доставивший соответствующий декрет, был арестован в Багдаде и казнен. В 1831 году армия под командованием нового правителя Али Рида-паши выступила из Алеппо в Багдад, где почти не встретила сопротивления. Город и гарнизон сильно пострадали от разлива Тигра и эпидемии чумы. К самому Дауду отнеслись благосклонно, и он окончил свою жизнь хранителем святынь в Медине. Мамлюки были уничтожены. Таким образом, Порта вернула Ирак за год до того, как сын Мухаммеда Али-паши Ибрагим завоевал Сирию.