Из новых центров особенно выделяется Трабзон, расположенный на юго-восточном берегу Черного моря, поскольку он стал центром процветающей империи, существовавшей 250 лет – в 1204–1461 гг. Во время сельджукских набегов XI в. представитель местной знати Феодор Гаврас всячески старался сделать его относительно независимым от Константинополя. В 1204 г. два внука императора Андроника (1182–1185) установили контроль над Трабзоном с помощью грузинской царицы Тамары. Опираясь на его традиционную автономию, так же как на его природные ресурсы, Давид и Алексей Комнины сделали город новой столицей. Он стал международным центром черноморской торговли, частично потому, что контролировал западный конец одного из самых важных сухопутных торговых путей с Дальнего Востока и таким образом мог повысить свои доходы от торговых сборов. Источником богатства Трабзона также были серебряные рудники в Понтийских Альпах, которые являлись его природной защитой с юга.
Аллитерационное название романа Розы Маколей «Башни Трапезунда» основано на романтическом представлении о живописном черноморском городе с возвышающейся над морем цитаделью, а также великолепными церквами и монастырями, среди которых есть церковь Св. Евгения – покровителя города. Башни были в основном перестроены в XIII и XIV вв. императорами, также построившими дворец в цитадели, который очень красиво смотрится над Черным морем. Они основали династию Великих Комнинов, чтобы подкрепить свои претензии – преемников византийских правителей, и пошли по проторенному пути филантропов – начали строить церкви и монастыри. В середине XIII в. Мануил I основал монастырь Св. Софии, сильно перестроенный позже, в котором сохранились удивительные фрески и резные украшения. И административные, и торговые институты Трапезундской (Трабзонской) империи смоделировали по константинопольским. Генуэзским и венецианским купцам были дарованы привилегии и выделены для поселения кварталы, примыкавшие к гавани, которой также активно пользовались кавказские и русские торговцы.
Трабзон всегда считался очень красивым местом. В XI в. местный ученый Иоанн Ксифилин (позже ставший константинопольским патриархом) написал повествование о мученичестве св. Евгения и творимых им чудесах, среди которых было излечение нескольких скифских воинов (варягов). Позже местный церковнослужитель Иоанн переписал чудеса с добавлением интересных деталей. Святого он назвал «величайшим очарованием, славным именем Востока и золотого Трапезунда». Но самые важные описания Трабзона содержатся в двух известных речах: Иоанна Виссариона, который родился в этом городе около 1400 г. и позже стал кардиналом католической церкви, и клирика Иоанна Евгеника, посетившего город в середине XV в., чтобы увидеть место, где родился его отец. Эти риторические восхваления, следующие установившимся законам жанра (
Благодаря пограничному положению Трабзон служил перевалочной базой для идей и товаров из мусульманского халифата и территорий, расположенных еще дальше к востоку. В 1290-х гг. Григорий Хиониад, греческий монах, путешествовал из Трабзона в Тебриз, столицу монгольских ильханов (в современном Иране), чтобы узнать больше об арабской астрономии у знаменитого ученого по имени Шамссуддин аль-Бухари. Результатом его учебы стал перевод ключевых арабских текстов по астрономии и применению астролябии. Это один из немногочисленных примеров принятия Византией превосходящих знаний зарубежной культуры. После возвращения Хиониад стал преподавать астрономию и медицинскую науку в Константинополе, используя свою обширную библиотеку научных и медицинских трудов. Важность его греческих переводов была признана намного позже Коперником, который взял их за основу во время своей работы над планетарными моделями. В 1305 г. Хиониад вернулся в Тебриз епископом и в течение пяти лет служил в христианской общие ильханата, после чего вернулся в Трабзон и удалился в монастырь, где умер около 1320 г.