«Аэрофлот» стал стартовым заказчиком российских региональных самолетов нового поколения Sukhoi Supeijet 100, разрабатывавшихся АО «Гражданские самолеты Сухого» в широкой международной кооперации с ведущими западными поставщиками авиадвигателей, авионики и бортовых систем (стратегическим партнером выступила итальянская Alenia Aermacchi группы Finmeccanica, ныне — Leonardo Finmeccanica). Твердый контракт на 30 лайнеров был заключен с национальным перевозчиком в декабре 2005 г. — за 2,5 года до начала летных испытаний первого опытного самолета, взлетевшего 19 мая 2008 г. К серийным поставкам производитель смог приступить после сертификации машины Авиарегистром МАК: сертификат типа за номером CT332-RRJ-95 был оформлен 28 января 2011 г. (сертификационное название самолета — RRJ-95B). Год спустя, 3 февраля 2012 г., разработчику был вручен и сертификат типа Европейского агентства по авиационной безопасности EASA, что явилось серьезной победой «Гражданских самолетов Сухого», ведь SSJ100 стал первым российским пассажирским лайнером, сертифицированным по европейским авиационным правилам.
Первые десять SSJ100-95B комплектации light были получены «Аэрофлотом» в период с июня 2011 по сентябрь 2012 гг. в лизинг от компании «ВЭБ-лизинг». Затем, с мая 2013 по июнь 2014 гг., была произведена предусмотренная контрактом замена ранее поставленных машин на самолеты комплектации full. Все «суперджеты» для «Аэрофлота» имеют двухклассную компоновку пассажирского салона на 87 мест (12 — в бизнес-классе и 75 — в экономическом). Лайнеры в комплектации full отличаются от версии light несколько измененным составом оборудования и улучшенным комфортом для пассажиров. В частности, на них применяются обновленная система управления полетом, метеорадар с функцией определения сдвига ветра, добавлены еще одно рабочее место бортпроводника, третий туалет и четвертый кухонный модуль. Для пассажиров предусмотрен индивидуальный обдув над каждым креслом.
Согласно годовому отчету «Аэрофлота» за 2009 г., ставка лизинга за каждый из десяти поставлявшихся ему SSJ100-95B по договору с «ВЭБ-лизингом» от 20 августа 2009 г. составляла 164 тыс. долл, в месяц (цена самолета — от 23,5 до 24,2 млн долл.) при сроке финансовой аренды 12 лет. Таким образом, «Аэрофлоту», как стартовому заказчику, были предоставлены существенные скидки от цены самолета по каталогу (на тот момент — около 30 млн долл., с 2010 г. — 31,7 млн долл.). Кроме того, по условиям договора, финансовые потери от простоя самолетов по техническим причинам компенсировались авиакомпании производителем.
Первый пассажирский рейс SSJ100-95B (RA-89001) в «Аэрофлоте» состоялся 16 июня 2011 г. по маршруту Москва— С.-Петербург, на следующий день начались полеты в Нижний Новгород и Екатеринбург, а затем и по другим направлениям. Несмотря на неизбежные для любого нового типа самолета сложности при вводе в коммерческую эксплуатацию, уже в первый год коммерческих полетов на SSJ100 в «Аэрофлоте» были продемонстрированы довольно высокие показатели: с июня 2011 по июнь 2012 гг. на них было выполнено 3710 рейсов с общим налетом 6865 ч, перевезено 220 тыс. пассажиров. Отдельные самолеты при этом демонстрировали ежемесячный уровень налета вплоть до 250 ч, а рекорд по суточному налету одного борта составил 16 ч.
Поставки следующих десяти самолетов «Аэрофлоту» стартовали в ноябре 2014 г. и продолжались до мая 2015-го. Лизингодателем на этот раз выступил «Сбербанк Лизинг». С ним же были заключены договора операционной аренды на самолеты третьей заключительной десятки, поставлявшиеся в компанию с октября 2015 г. К концу прошлого года в эксплуатацию поступили четыре из них, в январе 2016-го — еще два, в апреле — седьмой, в конце мая — восьмой (им стала машина с «юбилейным» серийным номером MSN 95100), а 1 июня — девятый. Заключительный, 30-й самолет по контракту 2005 г. «Аэрофлот» готовится принять до конца июня. Однако на этом поставки SSJ100 в группу «Аэрофлот» не закончатся: в январе 2015 г. было подписано соглашение еще на 20 таких лайнеров. Ожидается, что они будут поступать в дочерние компании национального перевозчика в 2017—2018 гг. Таким образом, флот группы «Аэрофлот» через несколько лет может насчитывать уже 50 «суперджетов».