Нельзя сказать, что новая власть «не видела» этих процессов. Думается, совсем не случайно ЦК РКП(б), рассматривая на своем заседании 19 мая 1918 г. вопрос об «агитации духовенства», предложил к использованию следующие меры: «Повести против духовенства усиленную письменную агитацию. Поручить ее ведение тт. Сосновскому, Ем. Ярославскому и Демьяну Бедному, ассигновав необходимую сумму из кассы ЦК. Одновременно поручить тт. из президиума Московского совета принять меры по вселению городской бедноты в монастырские и иные духовные дома. Сообщать об этом решении ЦК партийным работникам, едущим на места для проведения его в жизнь» [243].
Осознала власть и необходимость создания специального органа в системе государственного управления, который взял бы на себя координацию действий в центре и на местах по реализации норм и положений декрета. Необходимость создания некоего «органа по делам религий» активно поддерживал В.Д. Бонч-Бруевич. До весны 1918 г. ему приходилось выступать в роли посредника между государством и религиозными организациями. Председатель Совнаркома В.И. Ленин именно ему поручал разбор поступающих обращений от верующих и духовенства, и сам пользовался его советами по этим вопросам. Принимал Бонч-Бруевич и те многочисленные делегации от верующих, которым удавалось доходить до Совнаркома.
13 апреля 1918 г. Совнарком поручил Наркомюсту образовать при наркомате Межведомственную комиссию в составе представителей различных комиссариатов и религиозных организаций (православных, католических, протестантских и т. д.)[244]. Она должна была взять на себя задачи создания условий для претворения в жизнь декрета об отделении церкви от государства, разбора конфликтных ситуаций, разработку предложений по «уточнению» декрета.