В 1940 г., несмотря на объективные трудности с передислокацией на новый аэродром и перевооружением, личный состав 42-го ИАП провел учебно-боевую подготовку на довольно высоком уровне, всего налет с 1 января по 25 октября 1940 г. составил 5572 часа, 11190 посадок, т.е. в среднем по 76 часов на летчика. Было выполнено 720 маршрутных полетов и 152 полета на детальную ориентировку. Проведено 503 воздушных стрельбы по конусу, из которых выполнено 371, то есть в среднем по 7 проведенных стрельб на летчика, или 5 выполненных. 587 стрельб по наземным целям, из них выполнено 346, или в среднем по 8 проведенных стрельб на летчика, или 5 выполненных. Проведено 216 бомбометаний (в том числе 204 с пикирования), из которых выполнено 110. Отработано 670 индивидуальных и 136 групповых воздушных боев (максимально участвовали 6 самолетов), в среднем по 9 одиночных и 1,5 групповых воздушных боя на летчика.
Столь интенсивная подготовка естественно имела и обратный эффект- количество летных происшествий было довольно значительным. Всего в полку с 1 января по 25 октября 1940 г. произошло: аварий - 5, поломок - 13, вынужденных посадок - 7, аварий моторов - 5. В результате 3 самолета были полностью разбиты.
В целом же на фоне других частей по уровню УБП полк смотрелся вполне достойно, уступая только 31-му ИАП, что собственно и было отражено в Кратких выводах о боевой подготовке частей ВВС 1-го управления ГУ ВВС КА о ходе УБП на начало января 1941 г.: «42-й ИАП - полк в составе 58 экипажей выполняет боевые задачи на средних высотах днем в простых метеоусловиях. Ночью подготовлено 15 экипажей. Летают на высоте 7000 м. 35 пилотов». Впрочем, до оптимальных показателей лучших частей ВВС ДВФ было конечно далеко. Для того чтобы достичь заветных 150 часов налета и 25-30 стрельб на каждого летчика, надо было провести вторую половину года в том же темпе, что и начало. Однако это было невозможно ввиду того самого перевооружения и передислокации.
Тем не менее к концу года были созданы все предпосылки для того, чтобы в 1941 г. довести подготовку личного состава до самого высокого уровня. На 1 января 1941 г. 42-й ИАП был уже крепкой кадровой частью. В полку все 73 летчика прослужили более года, а примерно 50% - больше двух лет. Личный состав в целом переучился на И-153. Полк был полностью укомплектован боевыми самолетами и базировался в прекрасно оборудованных ангарах Вильнюсского аэродрома Парубанек.
Боевой состав части на 12 января 1941 г.:
- управление: три И-153, один И-15бис, один УТИ-4, один Ут-2, один Ут-1, три боевых экипажа;
- 1-я АЭ: 15 И-153, один И-15бис, один УТИ-4, три Ут-1, 15 боевых экипажей;
2- я АЭ: 15 И-153, 1 Ут-2, 1 У-2, 16 боевых экипажей;
3- я АЭ: 15 И-153, 15 И-15бис, один У-2, 19 боевых экипажей;
4- я АЭ: 15 И-153, три И-15бис, два Ут-1, один У-2, 19 боевых экипажей.
Из 63 И-153 52 были оборудованы радиостанциями РСИ-3, 10 из которых были приемо-передающими.
За 1940 г. из полка убыли все комэски, на их место были выдвинуты их заместители капитаны Андрей Александрович Обозненко - 1-я АЭ, Георгий Алексеевич Пантелеев - 2-я АЭ, Василий Александрович Зайцев - 3-я АЭ, Александр Семенович Агафонов - 4-я АЭ.
Начало 1941 г. в целом соответствовало этому прогнозу, в январе налет полка составил 205 часов, в феврале- марте по 500 часов, в апреле интенсивность УБП несколько снизилась из-за погодных условий, и личному составу удалось налетать только 360 часов. Однако уже в мае вместе с хорошей погодой показатели вновь выросли до приемлемого уровня, налет составил 510 часов. За пять месяцев, до 1 июня (после данные отсутствуют) летчики полка провели 218 стрельб по конусу, выполнили 138 маршрутных полетов, 79 индивидуальных и 6 групповых воздушных боев.