Между тем, несмотря на печальное начало, войска собрались вдоль Тюрингского леса, чтобы остановить французов. Настало время проявить постоянство и воспользоваться преимуществами, которые предоставляла такая позиция. Левый берег, на котором находился лагерь пруссаков, представлял собой обрывистые высоты, подножие которых омывалось рекой, а вершины были покрыты продолжением леса. Помимо Йены и Наумбурга, существовало лишь три места, где можно было перейти Заале, – Лобштедт, Дорнбург и Камбург, удаленные на расстояние двух лье друг от друга и весьма удобные для обороны. Не было участка более выгодного для генерального сражения, чем левый берег Заале. Армия была лишена 10 тысяч человек авангарда герцога Веймарского [Карла-Августа], посланного в разведку за Тюрингский лес; она понесла потери в 5–6 тысяч убитыми, пленными и беглецами в боях при Шлейце и Заальфельде, но оставалось еще 50 тысяч человек князя Гогенлоэ, 66 тысяч герцога Брауншвейгского, 17–18 тысяч Рюхеля, то есть 134 тысячи человек, – весьма грозная сила на такой позиции, как Заале от Йены до Наумбурга. Выставив крупные подразделения перед главными переходами, а основную массу несколько сзади, на центральной позиции, армия была в состоянии дать французам опасное для них сражение и если не вырвать победу, то по крайней мере оспорить ее настолько, чтобы сделать отступление легким, а исход войны неопределенным.
Но сумятица в умах прусского генерального штаба лишь нарастала. Герцог Брауншвейгский, который до сей поры выказывал верность суждения и оценивал преимущества занятой позиции в самых различных случаях, теперь, когда один из таких случаев, и притом самый предсказуемый, осуществился, казалось, внезапно утратил здравый смысл и хотел со всей поспешностью снять лагерь. Движение Даву на Наумбург стало для него озарением. Из появления маршала в Наумбурге он заключил, что Наполеон хочет не дать сражение, а стремительно двинуться на Эльбу и отрезать пруссаков от Саксонии и даже от Пруссии, как он отрезал генерала Мака от Баварии и от Австрии. Страх быть окруженным, подобно генералу Маку, и вынужденным, как он, сдать оружие, тревожил ум этого несчастного старика, обыкновенно ясный. Поэтому он хотел немедленно отправляться на Эльбу: сняться с лагеря и форсированными маршами передвинуться на Эльбу, прикрывшись Заале, что влекло за собой оставление французам Лейпцига, Дрездена и всей Саксонии. Князь Гогенлоэ, после того как запоздало решился отойти за Заале, стоял лагерем на высотах Йены. Герцог Брауншвейгский предписал ему там и оставаться, чтобы прикрыть этот переход, в то время как главная армия, пробравшись позади Силезской армии, выйдет к Заале в Наумбурге и спустится вдоль нее к Эльбе.
Генералу Рюхелю герцог приказал остановиться в Веймаре на время, необходимое для присоединения авангарда, а сам, уводя пять дивизий главной армии, решил сняться с лагеря 13-го, следовать до моста в Наумбурге, оставить три дивизии для его охраны – в то время как он с двумя другими пойдет убедиться в переходе через Унштрут, один из притоков Заале, – затем, миновав эту преграду, отозвать три дивизии, оставленные в Наумбурге, подтянуть к себе князя Гогенлоэ и генерала Рюхеля и следовать вдоль берегов Заале до ее слияния с Эльбой в окрестностях Магдебурга.
Таков был план отступления, задуманный герцогом Брауншвейгским. Главная армия получила приказ выступать днем 13-го. Армия герцога Брауншвейгского пришла в движение, возглавляемая королем, принцами, королевой и сопровождаемая такой массой обозов, которая делала невозможными любые маневры. Пушки слышались так близко, что присутствие королевы Луизы в штаб-квартире стало затруднительным. Бывшее поначалу неудобством, ее присутствие сделалось опасным и тревожило короля. Ему пришлось отдать строгое распоряжение, чтобы заставить ее уехать. Она удалилась со слезами на глазах, после боев в Шлейце и Заальфельде не сомневаясь более в гибельных последствиях политики, несчастной зачинщицей которой стала.
В то время как герцог Брауншвейгский двинулся на Наумбург, князь Гогенлоэ, оставшийся на высотах Йены с 50 тысячами человек и имея в арьергарде генерала Рюхеля с 18 тысячами, занялся наведением некоторого порядка в своих войсках. Разделяя мнение герцога Брауншвейгского, что французы движутся на Лейпциг и Дрезден, чтобы первыми оказаться на Эльбе, он почти не беспокоился о Йене и не заботился о высотах, расположенных за городом.