Для генерала, конечно, лестным было то, что император так высоко оценил его службу. В то же время В.И. Бебутов видел, что генералу не хотелось уезжать из Грузии, где он был на подъеме, жил теми делами, которые планировал. Ему очень хотелось воочию видеть плоды своей работы. И он очень переживал. Но, как он сам подчеркивал: приказ есть приказ и его нужно выполнять. Одновременно генерал воочию увидел, каким уважением он пользуется в Грузии. То, что случилось, когда о его отъезде узнало грузинское дворянство, поразило многих, в том числе и генерала.
Дворянство Грузии обратилось к маркизу Паулуччи с просьбой разрешить послать от них поверенного с прошением к императору об оставлении генерала Паулуччи главнокомандующим. Это было вызвано тем, что подобные действия дворянство могло осуществлять только с позволения местного начальства. Конечно, генерал Паулуччи мог отказать дворянству, но это неминуемо вызвало бы негативную реакцию оскорбленного отказом грузинского дворянства. Поэтому генерал в связи с этим направил письмо министру полиции, в котором, ссылаясь на то, что он не мог отказать дворянству в просьбе, дал свое позволение на выезд в столицу надворному советнику князю Захару Орбелиани в качестве поверенного от Грузинского дворянского общества. Он просил министра оказать содействие, чтобы представить его императору. При этом генерал подчеркнул, что задерживается в Тифлисе только потому, что дожидается приезда генерал-лейтенанта Ртищева, чтобы передать ему дела.
Генерал Паулуччи откровенно писал министру о том, что после назначения его управлять Закавказским краем, который застал «в совершенном беспорядке и который всеми мерами старался привесть в лучшее устройство, то для меня теперь весьма прискорбно оставлять свои труды ничтожными». Он просил ходатайствовать перед императором, чтобы просьба «Грузинского дворянства не имела уважения в таком случае, если благоугодно будет Е. И. В., после отъезда моего из Грузии, опять меня же сюда назначить, так как сие послужило бы к совершенному моему разорению».
В столицу Петербург выехала специальная депутация закавказского дворянства, чтобы просить императора оставить генерала Паулуччи в Грузии. Александр I, польщенный тем, что его выбор совпал с общественным мнением на Кавказе, милостиво принял просьбу грузинских делегатов, но переменить свое решение отказался, мотивируя это подготовкой к большой войне, в которой генералу Паулуччи он отводил важную роль.
Генерал Паулуччи был назначен начальником Главного штаба 1-й армии, находившейся в это время на западной границе России. Она непосредственно должна была противостоять французской армии в случае ее вторжения на территорию Российского государства.
Отъезд генерала Паулуччи из Тифлиса к новому месту службы оказался весьма знаменательным и для В.И. Бебутова. Уезжая из Грузии, генерал Паулуччи предложил В.И. Бебутову остаться его адъютантом и поехать вместе с ним. Такое предложение для В. Бебутова и его родителей было весьма лестным, поскольку свидетельствовало о высокой оценке командующим его как адъютанта, офицера. И он с удовольствием принял предложение. Ему очень хотелось принять участие в надвигавшейся большой войне, о которой только и было разговоров вокруг. Да ему и хотелось побывать в новых местах, повидать мир, пообщаться с людьми. Он также рассчитывал посмотреть Петербург, побывать в корпусе, встретиться с преподавателями, друзьями.
В это время император Франции Наполеон усиленно концентрировал свои войска в герцогстве Варшавском на границе с Россией, что расценивалось как подготовка к войне с Россией. Генерал Паулуччи был назначен начальником штаба Западной армии, а затем 1-й армии, штаб которой располагался в Вильно. Армией командовал военный министр Барклай де Толли. Когда прибыли в Вильно, генерал приступил к исполнению обязанностей. Вскоре между ним и командующим Барклаем де Толли начались трения по вопросам ведения военных действий во время войны. В ночь с 12 на 13 июня 1812 г. Наполеон без объявления войны двинул свои войска через Неман. Генерал Паулуччи высказал мнение о том, что не нужно держаться за укрепленные лагеря и защищать их, поскольку они легко могли оказаться в окружении и быть отрезанными от основных сил.
Когда в июне 1812 г. состоялось вторжение французов на территорию России и началось война, то Дрисский лагерь русскими войсками был оставлен и началось отступление. Но в связи с разногласиями с Барклаем де Толли генерал Паулуччи был отстранен от занимаемой должности. В.И. Бебутов вместе с генералом Паулуччи оказались какое-то время не у дел. Генерал Паулуччи очень переживал случившееся.