В окружении императора поговаривали о том, что Наполеон главный удар может нанести через Прибалтику на столицу России Петербург. Поэтому, по мнению императора, в Прибалтике должен был находиться боевой генерал, способный организовать отпор врагу и преградить путь на столицу. Исходя из этого, он вскоре остановил свой выбор на генерале Паулуччи и назначил его лифляндским и курляндским генерал-губернатором и командиром отдельного корпуса. Перед генералом Паулуччи была поставлена задача в случае наступления французов на Петербург не только остановить врага, но и, разгромив его, обратить в бегство и преследовать до самой Франции.
Прибыв в Прибалтику, в условиях начавшейся войны генерал Паулуччи принялся за дело. Быстро разобравшись в обстановке, он увидел, что для отпора противнику ничего здесь не готово и предстоит сделать очень многое в короткое время. Поэтому с первых дней пребывания в регионе он уделял большое внимание организации обороны вверенного ему края.
Со свойственной ему энергией генерал Паулуччи предпринял решительные меры по приведению в порядок имевшихся военных сооружений, крепостей, намечал строительство новых укреплений на особо опасных участках возможного наступления и прорыва противника. Им определялись рубежи, на которых следовало остановить наступающие вражеские войска в случае их вторжения в Прибалтику и продвижения к Петербургу. Многое из этого он перекладывал на своего адъютанта Бебутова, которому много приходилось двигаться по Прибалтике, выполняя поручения командующего. Задача была очень трудной и сложной, так как войск было немного, а удар противника мог быть огромной силы, поскольку командованию русской армии было известно примерное количество французских войск, концентрирующихся на российской границе.
Генерал Паулуччи был все время в движении, лично посещая определенные им объекты. В.И. Бебутову, как его адъютанту, приходилось много заниматься подготовкой войск в Прибалтике к отпору врагу, стремившемуся к российской столице. Ему, как и другим адъютантам, приходилось очень много ездить по Прибалтике, не только сопровождая генерала Паулуччи, но и выполняя его поручения. В 20 лет с небольшим для него это было не обременительно, а даже интересно и во многом поучительно. Он был горд тем, что причастен к большому делу подготовки в надвигавшейся войне, что и от него в какой-то мере в предстоящих сражениях зависит судьба России.
Находясь в отдельном корпусе, князь Бебутов вместе со всеми хотел защищать Россию. Для наступления на российскую столицу предназначался корпус Макдональда, который должен был наступать из района Кёнигсберга, Тильзита, через Неман в Прибалтике. Но Наполеон, в конце концов, решил нанести главный удар не на Петербург, а на Москву, чтобы поразить Россию, как он считал, в самое сердце, поскольку вторая столица была русскому народу значительно дороже, чем холодный Петербург.
Таким образом, Прибалтика оказалась второстепенным театром военных действий. Наступление на Петербург скорее носило отвлекающий характер для того, чтобы русское командование не могло перебросить воинские части из Прибалтики против французов, действовавших на московском направлении, тем более нанести удар в тыл наступающей французской армии, отрезать ее от баз снабжения и окружить. Но это не означало, что военные действия здесь могли идти вяло. Французское наступление требовало предельной концентрации сил не только для сдерживания войск, но и активных действий против врага, нанося ему существенный урон, а при первой же возможности следовало перейти в контрнаступление.
Войска отдельного корпуса, возглавляемого генералом Паулуччи, не могли с началом вторжения французов сразу вступить в боевые действия с ними, поскольку непосредственно с Макдональдом первыми соприкасались войска виленского губернатора Эссена. Но генералу Паулуччи следовало и дальше укреплять позиции в генерал-губернаторстве, чтобы в случае прорыва через Прибалтику французские войска не могли пройти на Петербург. Таким образом, генерал Паулуччи оказался на второстепенном театре военных действий, что его, видимо, немало огорчало.
Князь Бебутов неоднократно просил генерала Паулуччи отпустить его в полк, в котором он числился, где он мог бы по-настоящему участвовать в боях с противником. Но тот был непреклонен. Он не хотел отпускать молодого толкового адъютанта и держал его при себе. Хороший адъютант многого стоит, так как от его грамотных действий может зависеть успешное выполнение поручений командующего. Нередко от того, насколько точно и верно он передаст распоряжение или приказ командующего, многое зависело в проведении боевой операции. Адъютант должен быть не только простым исполнителем, передатчиком приказов, но и хорошим помощником, думающим, умеющим ориентироваться в складывающейся обстановке.