Такие же беспорядки имелись в делах городского суда и полицейских мест, откуда не доставлялись ведомости о решенных и нерешенных делах. Поэтому часть из них осталась безгласной, а по многим бумагам длительное время не было сделано необходимых распоряжений. Генерал Бебутов пришел к выводу, что эти беспорядки допущены прежде всего не по нерадивости или недостатку деятельности членов областного правления, а из-за отсутствия подготовленных кадров, неумения работать, низкой требовательности к ним.
Приступив к исполнению своих обязанностей начальника области, В.И. Бебутов особое внимание уделил организации управления, подбору людей, которые бы в кратчайшие сроки могли наладить нормальную жизнь области. Он с первых же дней предъявил жесткую требовательность к членам правления за результаты работы. Прежде всего были приняты меры к тому, чтобы давать законный ход делам и скорейшему их окончанию, производившимся в полицейских местах, городских судах с последующей информацией об этом. Областное правление должно было усилить контроль и наладить строгий учет, особенно по уголовным делам. Но при этом начальник столкнулся с тем, что в области не имелось комплекта канцелярских чиновников и служителей, определенных по штату для Армянской области, особенно в областном правлении. Многие места оказывались вакантными. Поэтому новый начальник области очень внимательно рассмотрел положение с кадрами. Обо всем этом он уже 5 февраля докладывал фельдмаршалу Паскевичу, подчеркнув, что «все эти беспорядки допущены не от нерадения или недостатка деятельности бывших членов Армянского областного правления, а по причинам известным уже в. с. из донесений областного правления». Для предотвращения беспорядков «я принял надлежащие меры для производящихся дел давать законный ход и о скорейшем их окончании».
В то же время он понимал, что сделать это было чрезвычайно трудно. Он повел линию по укреплению армянских позиций на вверенной ему территории. Особое внимание было уделено реорганизации управления областью. В результате система управления была изменена, что расширило его полномочия и ликвидировало совещательные органы. 23 июня 1830 г. российское правительство приняло положение о структуре управления Армянской областью. Оно внесло в ее административно-территориальное деление изменения. Теперь область состояла из четырех округов – Иреванского, Шарурского, Сурмалинского и Сардарабадского, которые состояли из магалов (округов). Нахичеванская провинция и Ордубадский округ сохранили свое прежнее административно-территориальное деление.
Ему пришлось провести огромную организационную работу. Для этого потребовались кадры управленцев, которых на месте не было, и никто специально их не готовил. Ему пришлось спешно подбирать их из числа офицеров, а также чиновников, уже служивших на Кавказе и знавших его специфику. По хозяйственной части распоряжалось областное управление по сборам податей и повинностей. Частное управление Эриванской провинцией состояло из провинциального суда, четырех окружных начальников и городской полиции. Суд был учрежден по образцу уездных судов Российской империи. Окружным начальникам подчинялись распоряжавшиеся по магалам наибы. Кочующие народы управлялись двумя султанами. Эриванская провинция по судной части управлялась провинциальным судом, а по хозяйственной – городским казначеем. Исполнительная и полицейская власть находилась в руках наибов, при которых состояли приставы из русских чиновников.
Будучи человеком военным по всему своему внутреннему содержанию и имея опыт работы в гражданском управлении, князь Бебутов добивался дисциплины на всех уровнях сверху донизу. И вскоре это стало давать свои результаты.
Особое внимание он уделил Эриванскому городскому суду, председателем которого был полицмейстер, вторым членом – городской казначей. Он пришел к выводу, что они не могут успешно выполнять делопроизводство и указы областного правления, так как оба чиновника, обремененные своими прямыми должностными обязанностями, не в состоянии были должным образом наладить работу городского суда. Поэтому там и шло все замедленно, что сказывалось на положении дел в городе.
Исходя из этого, начальник области поставил перед Паскевичем вопрос о замене в Эриванском городском суде полицмейстера, городского казначея другими гражданскими чиновниками, способными и сведущими, из которых один должен быть судьею, а другой – заседателем. Кроме того, Бебутов считал, что председательствование полицмейстера в городском суде неудобно еще и потому, что он, производя следствие по гражданским и уголовным делам, направлял их в городской суд. А там он и оказывал основное влияние на решение дел. Хотя в суде заседали еще члены из горожан, но они не только не знали судебных порядков, но зачастую даже русского языка.