Военно-морская разведка империи продолжала в полной мере использовать представившиеся ей с начала интервенции возможности по беспрепятственному заходу боевых кораблей 5-й эскадры в российские порты на побережье Японского моря и соединяющих его с Охотским морем проливов. В отсутствие там постоянно действующих резидентур 3-е отделение МГШ таким образом обновляло накопленный ею массив информации о навигационно-гидрографической, метеорологической, санитарно-эпидемиологической обстановке, портовой, транспортной инфраструктуре, системе связи, экономической ситуации, состоянии местной промышленности, органах власти, численности, национальном составе и настроениях населения.
В апреле 1921 г. линкор «Микаса» побывал в Сэйсине, Хверёне, Посьете, Тетюхэ, Императорской Гавани, Александровске-Сахалинском, заливах Святая Ольга и Америка. Спустя три месяца «Микаса» вновь совершил поход вдоль побережья Приморья и Нижнего Приамурья, посетив те же населённые пункты, за исключением того, что дополнительно зашёл в Де-Кастри[574]. Следует отметить, что с 1920 г. командование японского флота начало зачислять в состав экипажей боевых кораблей, нёсших службу в Приморье, на Северном Сахалине и Камчатке, выпускников Токийской школы иностранного языка по классу русского языка, которые ранее были или в дальнейшем стали сотрудниками военно-морской разведки: капитан-лейтенанта Гамо Такэси – в состав экипажа сторожевого корабля 1-го класса «Ивами» (1921–1922); капитан-лейтенанта Маэда Минору – в состав экипажа линкора «Микаса» (1921); капитан-лейтенанта Минодзума Дзюндзи – в состав экипажей крейсера 2-го класса «Титосэ» (1921) и сторожевого корабля 1-го класса «Ниссин» (1922–1923); капитан-лейтенанта Сакамото Тоси – в состав экипажа канонерской лодки «Могами» (1921); капитан-лейтенанта Танигути Госукэ – в состав экипажа вспомогательного судна «Канто» (1921–1922); капитан-лейтенанта Хисаэ Итиро – в состав экипажей сторожевых кораблей 1-го класса «Ивами» (1920–1921) и «Ниссин» (1921–1922). Будучи командирами боевых частей, по совместительству они исполняли обязанности переводчиков и офицеров агентурной разведки, что освобождало флот от необходимости зачислять в состав экипажей гражданских специалистов, свободно владевших русским языком, как это было в 1918–1919 гг.
Основные усилия разведорганов японского флота и армии в 1921–1922 гг. были направлены на изучение социально-экономических мероприятий меркуловского режима, отслеживание подготовки и реализации им кампании подавления краснопартизанского движения в Приморье с последующим переносом боевых действий в Хабаровск против НРА ДВР.
Из телеграмм контр-адмирала Накамура в Токио вытекала нелицеприятная для правительства Меркулова ситуация: в докладе командующего 5-й эскадрой от 8 августа 1921 г. прямо говорилось о невозможности объединения меркуловцев с контрреволюционными партиями, отсутствии единства в верхушке, нехватке финансов, росте числа забастовок рабочих под влиянием большевиков, разнузданном поведении хунхузов и других признаках кризиса, поэтому «по абсолютно достоверной информации, в случае вывода нашей армии [Временным Приамурским правительством] разработаны планы по эвакуации на Камчатку с необходимыми для этого вооружением и материалами»[575]. На положение дел не смогла повлиять даже успешно начавшаяся в ноябре 1921 г. кампания меркуловской армии по ликвидации партизанского движения в Приморье с последующим захватом Хабаровска, которая в итоге вылилась в отступление белых войск на исходные позиции и ухудшением их морального состояния[576].
15 ноября 1921 г. командующим 5-й эскадрой вместо контр-адмирала Накамура Масаки стал контр-адмирал Такэути Сигэтоси. В отличие от своих предшественников он никогда не занимался Россией и не проходил службу на боевых кораблях в Приморье, на Северном Сахалине или Камчатке, а был одним из ведущих на японском флоте специалистов по США: в 1912–1914 гг. Такэути возглавлял военно-морской атташат при японском посольстве в этой стране. 1 декабря 1921 г. 5-я эскадра была преобразована в 6-ю, а 13 апреля 1922 г. Такэути вместе со штабом покинул рейд Влади востока на борту возвращавшегося в Японию сторожевого корабля 1-го класса «Ивами». В Приморье остался прибывший туда 7 апреля сторожевой корабль 1-го класса «Ниссин». Несмотря на уход штаба 6-й эскадры, во Владивостоке до ноября 1922 г. находился капитан 3-го ранга Масаки Кацудзи, прикомандированный от разведки к управлению 3-го флота.
Постепенное сокращение японского военно-морского присутствия в Приморье было связано с неблагоприятным прогнозом на будущее для правительства Меркулова, которое, как докладывал Такэути 9 марта 1922 г. заместителям военно-морского министра и начальника МГШ, из-за ухудшавшейся обстановки на фронте, политических волнений и острой нехватки финансов постепенно впадало в безвыходное состояние[577].