После начала иностранной интервенции на советском Дальнем Востоке, в Забайкалье и Северной Маньчжурии задачи японского флота и его разведорганов были определены как контроль за обстановкой в Приморье и Нижнем Приамурье, что обеспечивалось базированием корабельной группировки 3-го флота на Владивосток, Хабаровск, Де-Кастри и Николаевск-на-Амуре в весенне-осенний период. Однако в связи с приходом к власти в Омске в ноябре 1918 г. А.В. Колчака и вспыхнувшим вслед за этим конфликтом с Г.М. Семёновым флот был вынужден направить в Сибирь своего резидента контр-адмирала Танака Котаро, который в феврале – мае 1919 г. сумел стабилизировать обстановку и наладить военно-техническое сотрудничество с Верховным правителем.
Вслед за падением колчаковского режима, фактическим захватом власти Советами на Дальнем Востоке на рубеже 1919–1920 гг. основные усилия японской военно-морской разведки были направлены на установление неофициальных контактов с новыми режимами и проработку деталей вывода императорских войск в метрополию. Однако уничтожение японской колонии в Николаевске-на-Амуре в марте – мае 1920 г. стало поворотным моментом в японской политике на советском Дальнем Востоке. Оккупация Северного Сахалина и Нижнего Приамурья отсрочили вывод японских войск до октября 1922 г., хотя военно-морская разведка прогнозировала постепенное ухудшение ситуации для императорской армии, даже несмотря на захват власти в Приморье в мае 1921 г. белогвардейским правительством С.Д. Меркулова.
В 1918–1922 гг. разведывательные органы 5-й эскадры и резидентуры 3-го отделения МГШ собрали большой объём информации о портовой инфраструктуре, навигационно-гидрографической, метеорологической, санитарно-эпидемиологической обстановке, состоянии судостроительной и судоремонтной базы, транспортной инфраструктуре, системе связи, численности, национальном составе и настроениях населения российского Дальнего Востока. Беспрепятственный доступ к кораблям Амурской речной и Сибирской военных флотилий позволил военно-морской разведке Японии детально изучить их тактико-технические характеристики, завязать полезные знакомства с офицерским составом. Часть информации флот получал от разведывательных органов Владивостокской и Сахалинской экспедиционных армий, часть – от офицеров судовой агентурной разведки, изучавших обстановку в российских портах во время кратковременных заходов в них кораблей 3-й и 5-й эскадр. Зимой 1920 г. впервые для получения сведений о положении дел в низовьях Амура японский флот задействовал свою разведывательную авиацию. Радиоразведка ВМФ в межвоенный период и в годы Гражданской войны (1906–1922) дальнейшего организационного развития не получила.
Зарубежный разведаппарат МГШ в Европе в силу своей малочисленности опирался в основном на информацию о РСФСР из открытых печатных изданий. В целях улучшения постановки разведывательной работы в июне 1920 г. 3-й отделение МГШ перевело свою резидентуру из Стокгольма и Парижа в Варшаву. В 1925 г. на её базе был организован военно-морской атташат при японском посольстве в Москве.
В результате потерь, понесённых в годы Первой мировой и Гражданской войн, советский флот по сравнению с 1 января 1914 г. сократился к 1 января 1923 г. с 12 линкоров до 2, с 14 крейсеров до 2, со 118 эсминцев и миноносцев до 15, с 30 ПЛ до 13, с 33 канонерских лодок до 7[584]. Сибирская военная флотилия после увода боевых кораблей контр-адми ралом Г.К. Старком в Манилу как боевая единица фактически перестала существовать. Поэтому военно-морская разведка Японии после вывода её войск с территории советского Дальнего Востока ограничилась созданием резидентуры во Владивостоке (1922–1924), направив свои основные усилия на сбор информации о флотах Великобритании, Германии, Франции и США: в декабре 1922 г. на Британских островах находились 13 офицеров и гражданских специалистов ВМФ империи, в Соединённых Штатах и Германии – по 7, во Франции – 5, в Китае – 3, в Польше – только 1[585].
Разведывательная служба военно-морского флота Японии была образована в 1872 г. в рамках поэтапного наращивания Вооружённых сил империи с целью реализации её континентальной внешней политики. Получив первый практический опыт в ходе японо-китайской войны 1894–1895 гг., военно-морская разведка превратилась к началу XX в. в хорошо организованную добывающую и информационную структуру Морского Генерального штаба.
Основу её зарубежного разведывательного аппарата составляли военно-морские атташаты при японских дипломатических миссиях, языковые и технические стажёры, легальные резидентуры под прикрытием коммерческих агентств, отдельные разведчики-нелегалы. Часть информации поступала от офицеров агентурной разведки боевых кораблей японского флота, которые совершали заходы в иностранные порты или несли стационерную службу.