Одному из англичан, линкору «Каллоден», не было суждено принять участие в сражении. Через несколько минут после первых выстрелов, торопясь как можно скорее попасть в гущу боя и для этого срезав угол, корабль жестко сел на мель возле острова Абукир. Команда «Леандра» предложила помощь, но Трубридж отказался, положившись на свои силы и находившийся здесь же «Мутин». А «Каллоден» направлял действия «Александра» и «Свифтшура».
Теперь действия сосредоточились вокруг «Франклина», «Ориента» и «Тоннанта». Какое-то время «Франклину» пришлось иметь дело только с «Леандром», который бросил якорь слева по носу, а «Ориент» и «Тоннант» вели бой, стоя правыми бортами к линкорам «Беллерофон» и «Маджестик». Естественно, «Беллерофон» не был равным противником для «Ориента». Его бизань- и грот-мачта были сбиты, и около восьми часов на нем перерубили якорный канат, и он стал медленно дрейфовать в сторону от центра сражения, по пути лишившись фок-мачты тоже. Почти сразу же «Свифтшур» бросил якорь за кормой в такой позиции, что мог вести огонь одновременно по «Ориенту» и «Франклину». А «Александр» прошел со стороны кормы от «Ориента» и остановился, носом к встречному ветру, слева по борту. Тем временем «Маджестик» и «Тоннант» вели дуэль равных противников, в которой оба капитана погибли.
Около девяти часов на корме «Ориента» возник пожар. Де Бруе уже был убит, а его капитан, де Каса Бьянка, смертельно ранен. Несмотря на все усилия команды, огонь распространился. Попытка затопить пороховой погреб оказалась неудачной, и около десяти часов корабль взорвался. Только 70 человек из команды, насчитывавшей почти 700 человек, спаслись. Гантом, начальник штаба, и несколько человек из команды добрались до брига «Саламин», остальных подобрали британцы.
Ввиду неизбежного взрыва и французские, и британские корабли изменили свои позиции. На «Александре» перерубили кормовой якорный канат и перешли на запасной становой якорь таким образом, чтобы корабль оказался вдоль борта «Тоннанта», который тоже спустился под ветер. Перед этим «Маджестик» медленно сместился со своей позиции на траверзе «Тоннанта» и столкнулся с линкором «Эрё». Изрядно пострадав от пожара, он освободился и стал на якорь в позиции между «Меркурием» и «Тоннантом», своим первоначальным противником. Корабли с наветренной стороны сохранили свои позиции, а с подветренной стороны – один за другим рубили якорные канаты или поднимали якоря. В результате «Франклин», стоявший перед «Ориентом», оказался в одиночестве под пушками кораблей «Дефенс», «Свифтшур» и «Леандр». Несмотря на это и несмотря на начавшийся пожар из-за осколков, разлетевшихся с «Ориента», это был первый корабль, открывший огонь после взрыва. Но это был последний всплеск активности: линкор лишился грот-мачты и бизани, у него осталось только три действующих орудия, две трети команды были мертвы или ранены. Выхода не было – оставалось только сдаться. Следующим был «Пёпл-Суверен», который уже некоторое время пребывал в бездействии и без мачт.
К этому времени сдались уже все французские корабли от «Герриера» до «Ориента». Но осталось еще шесть кораблей на подветренном конце линии, и какое-то время только «Маджестик» и «Александр» находились в удобной позиции для боя с ними. Примерно в три часа утра 2 августа «Маджестик» лишился грот-мачты и бизани, а французские корабли медленно дрейфовали по ветру, так что «Меркурий» и «Эре» сели на мель. Примерно в это время «Тоннант» уже лишился всех мачт.
На два часа сражение приостановилось. Наконец, «Тесей», который спустился под ветер с западного конца линии и бросил якорь рядом с кораблями «Александр» и «Маджестик», открыл огонь по «Гийому Теллю» и «Женерё». Эти два корабля вместе с «Тимолеоном» и «Тоннантом» вскоре оказались вне досягаемости, а «Тесей», «Александр» и «Маджестик», к которым теперь присоединился «Леандр», сконцентрировались на «Эре» и «Меркурии». Тем временем «Голиаф» тоже бросил якорь возле «Тесея», а «Зилоус», на ходу на внешней стороне линии, отрезал путь и развернул назад фрегат «Юстис», который подходил к выведенному из строя «Беллерофону», и занял позицию, позволявшую ему защитить этот корабль.