Сбылись и на членах братства пророческие слова Спасителя:
Для вынесения окончательного приговора сотрудникам ГПУ пришлось составлять три обвинительных заключения. В результате, «как политически неблагонадежных», епископа Иннокентия и отцов Льва и Гурия выслали из Петрограда на два года.
Тем не менее, благое дело, начатое ими, не угасало – работу Александро-Невского братства возглавил вдохновенный и ревностный иеромонах Варлаам (Сацердотский). Деятельность братства тогда заключалась в следующем: 1) организации церковной строго уставной службы; 2) организации хора; 3) организации занятий по Закону Божию с детьми; 4) организации богослужебного воспитания юношества и собраний, на которых проводилось чтение Евангелий и писаний святых отцов с последующим толкованием. Впоследствии отец Варлаам вспоминал: «Конечной целью членов руководимого мною братства было духовное самоусовершенствование путём полной преданности Церкви. Наиболее религиозно настроенные члены братства организовывали монашеские общежития, целью которых было подготовить себя и жить иноческой жизнью, оставаясь в миру…» [333, с.13] В феврале 1924 года был арестован и приговорен к двум годам концлагеря и иеромонах Варлаам.
Отец Лев (Егоров) отбывал ссылку в Оренбургской губернии, а затем в Казахстане. В конце 1924 года он вернулся в родной город, носивший к тому времени новое название – Ленинград. До осени 1926 года иеромонах Лев служил периодически, в качестве так называемого «наёмного батюшки», для совершения ранних обеден. В то же время ему пришлось подрабатывать, занимаясь переплетным делом.
Владыка Иннокентий, возвратившийся в апреле 1925 года, уже в декабре был вновь арестован и отправлен в ссылку. В город на Неве ему не суждено было вернуться. В дальнейшем он короткое время возглавлял ряд епархий, а в 1937 году был вновь арестован и погиб в заключении.
В июне 1925 года из туркестанской ссылки вернулся в Ленинград архимандрит Гурий (Егоров). Вскоре отец Гурий был назначен настоятелем Киновии Александро-Невской Лавры. В ней продолжали действовать церкви Пресвятой Троицы и Всех Святых. Постепенно архимандрит Гурий сделал Киновию одним из центров братской жизни.
В начале 1926 года вернулся из мест заключения в Ленинград и был возведен в сан архимандрита иеромонах Варлаам (Сацердотский). Он стал служить в Троицкой церкви Творожковского подворья, где его усилиями были сформированы два больших братских хора.
Отец Лев был также возведен в сан архимандрита в октябре 1926 года и назначен настоятелем Феодоровского собора на Миргородской улице. Этот храм, возведенный в память 300-летия дома Романовых, являлся одним из крупнейших в северной столице. В нем были две трехпридельные церкви – верхняя и нижняя, вмещавшие соответственно 2000 и 1500 человек. Вскоре туда потянулись многие верующие, привлеченные благолепными уставными службами и глубокой назидательностью отца настоятеля, который собрал вокруг себя значительное количество интеллигентных людей, вошедших в число членов братства. Архимандрит Лев стал также исполнять обязанности благочинного, преподавателя и члена педагогического совета Богословско-пастырского училища, руководителем которого являлся отец Гурий (Егоров).
Несмотря на явные угрозы со стороны властей, руководители братства продолжали готовить верных чад Церкви, способных продолжать их дело в условиях нового режима и распространять истины веры среди народа. Понимая, что душой христианства является монашество, богоборцы стремились к его полному уничтожению. Поэтому особой заботой отцов Гурия, Льва и Варлаама стала подготовка к иноческому постригу ряда их духовных чад. Под их окормлением работали кружки по изучению монашества, где изучались творения святых отцов и читались доклады по истории русского монашества XVIII–XIX веков – о Серафиме Саровском, Амвросии Оптинском, Игнатии Брянчанинове и других подвижниках благочестия.
К тому времени в городе уже существовали, под видом общежитий, две женские монашеские общины из числа братчиц, а вскоре приняли монашеский постриг в мантию наиболее подготовленные молодые люди.