Хотя шииты и другие жертвы тирании аль-Джаззара присоединились к французам, Башир II на это не пошел. Впоследствии он оказал помощь армии великого визиря, следовавшей в Египет, и был вознагражден декретом, поместившим Ливан под прямую юрисдикцию Порты. Перед лицом новых угроз со стороны аль-Джаззара он в 1800 году отбыл на борту британского военного корабля на Кипр, но в том же году смог вернуться. Он правил Ливаном до 1840 года. Смерть аль-Джаззара в 1804 году существенно укрепила его позиции. Главная цель его политики заключалась в замене феодальной системы более сильной и централизованной системой управления. В результате он в некоторых случаях вступал в конфликт с разными кланами друзов. Он преодолел их сопротивление с помощью армий из 15.000 человек, которую сумел создать. По политическим причинам он отдавал предпочтение маронитам. С другой стороны, он устроил подвергшихся преследованиям друзов из Алеппо в Ливане и поддерживал эмиграцию ортодоксальных христиан из Алеппо и Дамаска. Его собственные религиозные убеждения в точности не известны — представляется, что это был друзизм. Его доброта
к христианам натолкнула Ватикан и французских консулов на мысль, что он католик, и они заверили его в полной поддержке французов. В очень красивом дворце, который он построил в Байт эд-Дине — в горной местности недалеко от Бейрута, — была и мечеть, и часовня. После смерти в Стамбуле в 1851 году он был похоронен на армянском католическом кладбище.
С пашами, которые стали преемниками аль-Джаззара в Акке, Башир II, как правило, поддерживал хорошие отношения. Но, став хозяином Бекаа, он вступил в конфликт с одним из вали Дамаска и разгромил его в сражении в 1810 году. После этого он объединился со следующим вали, своим протеже, и отбил вторжение ваххабитов в Хауран, тем самым завоевав благосклонность Порты. Его политика являлась чрезвычайно дорогостоящей и требовала сурового налогообложения, что вызвало крестьянское восстание в 1820 году в главным образом маронитских северных районах. Не сумев подавить мятежников, которых поддерживали два его кузена, Башир отрекся от престола и удалился в Хауран. После короткого периода беспорядков вожди кланов в 1821 году снова призвали его и вернули на престол. Вскоре после этого он вступил в бой и разгромил вали Дамаска, который в период его отсутствия попытался захватить Бекаа. В этом случае Порта поддержала вали и предложила ему власть в Акке — в дополнение к Дамаску. Башир не покорился и предпочел отправиться в изгнание в Египет. Паша Акки отказался покинуть свой пост, и город был осажден. И он, и Башир в 1822 году были прощены и вернулись на свои посты, благодаря вмешательству Мухаммеда Али-паши Египта, на помощь которого Порта рассчитывала в борьбе против мятежных греков. Возвращению Башира воспротивился клан Джанполата, который в 1825 году организовал восстание против него. Оно было подавлено. Старая феодальная система оказалась частично ликвидированной, благодаря конфискации поместий мятежников. С тех пор многие друзы затаили обиду на своего эмира-автократа и их традиционных союзников — маронитов, которым достались многие конфискованные земли. Несмотря ни на что, о Башире II осталась добрая память. Он строил мосты и дороги, дал толчок развитию торговли через Бейрут, пытался внедрить современное образование. Его родственник Хайдар при нем написал историю Ливана при Шехабидах.
Во время изгнания в Египет Башир II вступил в союз с Мухаммедом Али-пашой, и, когда сын последнего Ибрагим-паша в 1831 году вторгся в Сирию, он выполнил свои обязательства, хотя и неохотно, поскольку почти все лидеры друзов были сторонниками дела османов. Марониты, с другой стороны, сначала приветствовали египтян. Войска Башира II внесли существенный вклад в победы Ибрагим-паши и его правление в Сирии. Падение египетского режима в 1840 году положило конец и долгому правлению Башира II в Ливанском эмирате. Это случилось в 1842 году.
Ирак и Курдистан в 1508–1831 годах