Против пяти чиновников, не свидетельствовавших о болезненном припадке, два чиновника давали показания в пользу умоисступления. Чиновник Морев обращал внимание на странность в поведении Протопопова в тот день, а также на крик вице-директора «возьмите, возьмите его, он с ума сошел». Начальник отделения Керстен подтверждал, что после происшествия Протопопов был в ненормальном состоянии. К двум сослуживцам присоединялись свидетели: сестра подсудимого и друзья семьи. В итоге получалось пять свидетелей в пользу умоисступления и пять – против.
Затем были заслушаны врачи-эксперты (тоже пять), и их мнения также разделились. Доктор Лозинский, который был вызван в департамент сразу после происшествия, свидетельствовал, что Протопопов был в нормальном состоянии. Доктор Шульце говорил, что на основе показаний свидетелей на процессе нельзя сделать заключение о том, что подсудимый был в нормальном состоянии во время преступления. Прокурор просил Шульце разъяснить, может ли человек в припадке умоисступления иметь понятие о противозаконности своего поступка. Ответы доктора никак не помогли обвинению, потому что он утверждал, что, начиная от насморка, все острые и хронические болезни могут сопровождаться припадками умоисступления; но вопрос о том, доказано ли, что подсудимый был в таком припадке, – это вопрос юридический, который не может разрешить врач. Следующий эксперт, тоже с иностранной фамилией, сомневался, что припадок Протопопова доказан. Последним, пятым выступал доктор с говорящей фамилией Чехов – эксперт, приглашенный защитником. «Всемирный труд» отмечал, что заключение именно этого доктора оказало большое влияние на приговор, и поэтому пересказывал его очень подробно. В представлении Чехова Протопопов выглядел однозначно больным человеком. Мать его была «истерическая женщина и в последние годы страдала расстройством умственных способностей», старшая сестра родилась глухой и полоумной. С пятнадцати лет Протопопов усердно трудился в канцелярии, а в последние десять лет начал страдать физическими недугами, которые оказывали влияние на его умственное и нервное состояние. С первых чисел июня подсудимый, очевидно, страдал нервным расстройством и поэтому так бурно отреагировал на анонимное письмо.
Доктор Чехов перечислял специфические признаки расстройства в момент совершения преступления. Он обращал внимание на то, что Протопопова вырвало желчью, и утверждал, что «желчь есть признак всех болезней при мозговом расстройстве». Физические характеристики Протопопова тоже поддерживали диагноз об умственном расстройстве: сердце было расширено в правой половине, а печень увеличена, что «отрицательно влияет на состояние крови к мозгу». Вердикт эксперта был однозначным: Протопопов совершил преступление в припадке меланхолии, приведшей к умоисступлению.
В целом суть спора обвинения и защиты журнал суммировал так. Прокурор настаивал на том, что подсудимый в полном сознании совершил серьезное преступление и должен быть строго наказан. Протопопов и его защитник «
В заключение своей речи он подчеркивал, что обида Протопопова на несправедливое к нему отношение начальства не может являться смягчающим вину обстоятельством. Суд должен наказать его за то, что для восстановления своей чести обвиняемый избрал незаконный путь. Вместо того чтобы обратиться к вышестоящему начальству или выйти в отставку, он выбрал применение физической силы. Возможность применения насилия в служебных отношениях подрывала гражданский порядок, так как «ни один начальник не в состоянии был бы отправлять своих обязанностей, если бы он не был огражден законами и судом от подобных посягательств». В противном случае начальству приходилось бы исполнять свои обязанности «с револьвером в руках». Такое возможно только в диком состоянии, и поэтому преступление Протопопова несовместимо с цивилизованной гражданской жизнью, которую призван охранять закон и суд.