Большая часть важнейших представителей пристеночной толстокишечной микробиоты никогда в условный коробок с анализом не попадут. Не попадут в поле зрения врача-лаборанта и бактерии из тонкой кишки, если сдавать анализ кала, ведь кал формируется в толстой кишке.
Да даже если бы мы соскребли слой кишечной слизи и собрали образцы какашек с бактериями, возникла бы проблема культивирования — многие микроорганизмы не растут в обычных средах и, соответственно, не выявляются привычными нам посевами кала. Неслучайно в традиционном посеве кала на дисбактериоз/дисбиоз всего 20 разновидностей бактерий. А согласно современным данным в нашем кишечнике ПОКА выявлено несколько тысяч видов микроорганизмов{3}
. Помимо бактерий это и вирусы, и простейшие, и грибы (да-да, они тоже компоненты нормальной кишечной микробиоты!), а также другие организмы.Различия впечатляют, не правда ли: 20 и несколько тысяч! Что собрались анализировать посевом кала на дисбиоз? По меткому выражению одного из коллег, это все равно что встать на краю леса, копнуть лопаткой образец почвы и утверждать, что во всем лесу только такая почва и есть. Попробуйте пройтись по лесу, если не согласны.
В последние годы популярность набирает еще один метод диагностики кишечной микробиоты — газовая хромато-масс-спектрометрия (она же ХМС), которая оценивает продукты жизнедеятельности бактерий и других организмов и по этим продуктам определяет их виды и количество. Что не так с этим методом? Он опять-таки определяет только некоторые микроорганизмы (49 бактерий, два гриба и три вируса) при намного большем микробном разнообразии в нашем кишечнике. Не зная полного состава кишечных жителей, затруднительно делать какие-то выводы даже в случае, если мы нашли увеличение количества одних микроорганизмов по сравнению с другими. А почему вы решили, что это не норма? Применение ХМС осложняет недостаточное исследование методики на людях, в том числе страдающих болезнями органов пищеварения.
Наиболее точную информацию о качественном и количественном составе кишечной фауны может дать метод со сложным названием секвенирование гена 16S рРНК. Данный вид теста и его более современные собратья позволяют с высокой достоверностью сказать, кто и в каком количестве живет в нашем кишечнике. Для этого берется образец кала из толстой кишки или жидкость из тонкой кишки: мы же помним, что в разных отделах кишечника состав бактерий разный? Метод дорогой, трудоемкий и в рутинной практике малоприменимый. Скорее он важен для научных изысканий, нежели для конкретного пациента. Почему? Мы можем получить полную информацию о том, какие бактерии, грибы, вирусы и иные микроорганизмы живут в нашем кишечнике.
Мы можем провести их количественную оценку, то есть всех посчитать. Однако на современном этапе медицинская наука еще очень смутно понимает, что будут означать все эти находки.
Мы-то с вами как привыкли?
Повышены эти бактерии и снижены вон те — значит, надо сразу лечить. Современная гастроэнтерология оперирует другими понятиями.
Например, отмечено, что при определенных болезнях меняется соотношение одних типов бактерий к другим. А при некоторых заболеваниях мы и таких изменений пока не смогли установить. И самое главное: даже установив с точностью до последнего микробика изменения и доказав, что они характерны для определенной патологии, мы все равно не знаем, что с этими находками делать. Именно поэтому почти никогда кишечная микробиота (если мы не подозреваем кишечную инфекцию) в рутинной практике не должна тестироваться. В научной — пожалуйста!
Доктор, вы сказали, ПОЧТИ НИКОГДА микробиота не должна тестироваться у обычного пациента из поликлиники или частного медицинского центра. Значит, иногда ее все же определяют?
Да, иногда гастроэнтерологи занимаются тестированием и лечением непатогенных микроорганизмов. Сейчас я расскажу вам об одном из «легальных» дисбактериозов, который мы можем оценить и вылечить. Речь пойдет о синдроме избыточного бактериального роста (СИБР) в тонкой кишке.
Избыток роста
Согласно одному из определений СИБР — это «патологическое состояние, которое характеризуется повышением количества тонкокишечных бактерий с развитием диарейного синдрома и нарушением всасывания некоторых питательных веществ». Вот такое длинное медицинское определение. Бла-бла-бла, ничего непонятно, да?