Император, увидев, что ни угрозы его уполномоченных, ни самое оскорбительное обращение, ни суровые условия первой ссылки, ни самые извилистые рассуждения на дискуссиях не могут одолеть непоколебимую веру мужественного настоятеля, он созвал против него и обоих Анастасиев собор, на котором были прокляты они, святой папа Мартин, Софроний Иерусалимский и их сторонники, то есть все ортодоксы. Затем осужденные были переданы префекту столицы, который приказал жестоко выпороть их. Потом, чтобы помешать Максиму проповедовать его учение, ему отрезали язык до корня, но Бог все же позволил ему сохранить дар речи. Ему отрубили и ладонь правой руки, которой он написал столько сочинений в защиту православия. Таким же образом изувечили его ученика Анастасия. После таких пыток они были проведены через все двенадцать кварталов столицы, а затем увезены в ссылку в дальние крепости, к подножию Кавказа. Их отделили друг от друга и продолжали обращаться с ними очень грубо. Там монах Анастасий и Максим вскоре умерли – Анастасий 24 июля 662 года, а Максим 13 августа того же года. Апокрисиарий Анастасий пережил настоятеля на четыре года, в течение которых терпел жесточайшие страдания.
Такое мужество во время преследований и такая преданность истинной вере вскоре принесли победу ортодоксальному учению. Святой Софроний всей своей властью боролся против заблуждения монофелитов. Мартин Первый умирал за истину. Максим, вооружившись наукой и силой, стал бичом для монофелитов. Он же показал раболепному византийскому двору и честолюбивым византийским прелатам редчайшее явление: императорский сановник отказывается от гражданских должностей и надевает черную рясу монаха, тридцать лет своей жизни посвящает защите религии, которой угрожает утрата целости, предпочитает терпеть самые ужасные пытки, оскорбления, удары кулаков, плевки, но не лицемерит, признавая на словах взгляды, которых не принимает сердцем. Такие уроки веры и героических добродетелей оказали решающее влияние на исход спора. Учение о двух волях в Иисусе Христе, против которого так долго шла борьба, наконец созрело во множестве дискуссий; это учение Софрония и Максима было торжественно признано догматом ортодоксальной веры на Вселенском соборе 680 года при папе Агафоне.
На своем последнем заседании участники собора постановили, что признают решения четырех предыдущих Вселенских соборов и признали, что у Иисуса Христа две природы с двумя волями и двумя природными действиями, воли эти неделимы и нераздельны, не смешиваются, не противостоят одна другой, поскольку человеческая воля во всем следует за божественной волей, однако при этом не уменьшается и не уничтожается, и ни одна из двух природ не может остаться без воли.
Был провозглашена анафема создателям и приверженцам монофелитской ереси. В их списке есть имя Полихрония, монаха из Сирии, который вместе с патриархом Антиохийским Макарием обратил на себя внимание как пылкий сторонник монофелитства. Этот старый ребенок, как его называет собор, предложил доказать с помощью чуда истинность учения, которое он поддерживал. В актах пятнадцатого заседания описан опыт, который ему разрешили провести в присутствии участников собора и всего народа. Рассказ начинается так: «Мы опишем здесь, среди серьезных вопросов, рассмотренных на соборе, комедию, которую разыграл, словно в огромном театре, один тщеславный монах не только перед собранием Отцов, но и перед всеми горожанами. Когда Отцы вошли, им объявили, что Полихроний стоит у двери и просит его выслушать. Его впустили и спросили, какую веру он исповедует. Он ответил: «Свое вероисповедание я подвергну испытанию: буду молить Сына Божьего воскресить мертвеца. Если мертвый не оживет, пусть собор и император сделают со мной все, что захотят». Участники собора ответили: «Скажите нам, какой Символ веры вы положите на мертвеца, чтобы тот воскрес». Полихроний сказал на это: «Сначала я положу на мертвеца мой Символ веры, потом вы прочитаете его». «Вот полностью подготовленный мертвец, – сказали участники собора. – Принесите и положите на него Ваш Символ веры, чтобы мертвый воскрес, как Вы сказали».
Монах принес исписанный лист бумаги, который был скреплен печатью; на печати была вырезана монограмма Полихрония и надпись: «Константину, венчанному Богом, очень мудрому и великому государю.