В результате нанесенного турецкой армии поражения Ахалцихский пашалык был целиком занят русскими войсками. Теперь на этой территории нужно было установить российские порядки. Генерал Паскевич искал подходящую кандидатуру на пост начальника местного пашалыка. Он исходил из того, что должность эта очень ответственная и трудная. Здесь должен был находиться человек, который бы смог установить в кратчайшие сроки контакты с местным населением и поставить дело так, чтобы оно признало главенство России. При этом он исходил из того, что пашалык окружало население, живущее в горах, далекое от цивилизации, подчиняющееся собственным законам, не признающее главенства России. Будучи в зависимости от Турции, оно могло постоянно угрожать нападениями на живущее здесь население. Его выбор остановился на генерале Бебутове, которого он за два с лишним года успел неплохо изучить, наблюдая в деле и проявившего себя как администратор в Имеретии.
Генерал Паскевич, отдавая должное дипломатичности, выдержанности В. Бебутова, умению общаться с людьми, находить с ними общий язык, знанию местных обычаев, а также наличию опыта не только военной, но и административной работы, выбрал именно его. 17 августа генерал-майор Бебутов, неожиданно для него, был назначен начальником Ахалцихского пашалыка. Еще в 1810 г. русские войска под командованием генерала Тормасова были готовы взять штурмом крепость Ахалцих. Но тогда турок спасла эпидемия чумы, появившаяся как в гарнизоне Ахалциха, так и в русском лагере. Опасаясь этого, генерал Тормасов отступил в Грузию, что и спасло Ахалцих от включения в состав Российской империи. И вот теперь генерал Бебутов был главным начальником в Ахалцихе.
Назначая генерала Бебутова начальником пашалыка, генерал Паскевич обратил его внимание на то, что Ахалцих необходимо удержать за Россией любой ценой, как важный стратегический узел в регионе. При этом он подчеркнул, что завоевать территорию можно с помощью войск, но удержать ее можно только при условии завоевания доверия населяющего ее народа. Поэтому Паскевич просил В.И. Бебутова применить в управлении пашалыком весь свой такт, опыт, умение обращаться с населением, чтобы оно поддерживало Российское государство, в состав которого вошло.
Занявшись делами управления пашалыком, генерал Бебутов увидел, насколько это трудно. Он понимал всю сложность своего положения и считал, что оно будет нелегким. Территория была только что отвоевана у противника, и у начальника пашалыка, по существу, не было никакой опоры среди местного населения, подавляющая часть которого были мусульмане, которые проявляли свой фанатизм и непримиримость к русским войскам при защите крепости. Помимо того, у него было весьма незначительное количество войск, чтобы надежно защитить территорию пашалыка и противостоять проискам турок.
Правда, здесь был психологический момент, который работал на русских и на начальника пашалыка. Во время штурма и его окончания защитники крепости увидели, что русские солдаты не такие изверги, как их представляли. Они не совершали грабежей, не насиловали женщин. Более того, в ходе штурма они женщин и детей старались поместить в более безопасное место. Это вынуждены были признавать даже те, кто не испытывал к России теплых чувств. К примеру, об этом писал английский историк Д. Баделли в своей обобщающей книге по завоеванию Кавказа русскими в 1903 г.: «Следует отметить, что, по данным наших источников, победоносные войска проявили свою „природную“ доброту, помогая женщинам и детям укрыться в безопасных местах».
Вступив в управление пашалыком, генерал Бебутов прежде всего внимательно осмотрел крепость и окрестности, чтобы четко себе представить обстановку для организации ее обороны. Город и крепость Ахалцих были расположены в тесном ущелье, посреди гористой и чрезвычайно пересеченной местности. С юга Ахалцих ограждал высокий хребет Цхенис-Цхале, образуя как раз против крепости правый, нагорный берег реки. Доступ с этой стороны к городу был почти невозможен. С севера подходили разорванными отроги Карталинских гор, которые, охватывая его с востока и запада, постепенно сливались с высотами левого берега реки Посхов-чай. Как раз против северной части Ахалциха, на склоне горного хребта, один из уступов образовывал довольно обширную возвышенную плоскость, так называемые «Северные высоты», господствовавшие над крепостью. С юго-запада, обрываясь крутыми спусками к реке, подступала к самому городу и отчасти даже входила в черту его высокая гора Кая-даг, как продолжение Цхенис-Цхале. С этой горы, возвышавшейся над крепостью, обстреливалось не только окрестное пространство, но и внутренняя часть города. Только восточная сторона Ахалциха выходила в небольшую долину реки, которая не представляла в боевом смысле больших выгод.