На базе упразднённого специального морского экспедиционного отряда в Хабаровске 23 июля 1920 г. был образован специальный отряд охраны водного района на Северном Сахалине. Оперативно он подчинялся командующему 3-м флотом и отвечал за охрану водного района порта Александровск-Сахалинский и прилегающей акватории, навигационно-гидрографическое обеспечение Татарского пролива, конвоирование транспортных судов, защиту японских колонистов в Нижнем Приамурье, проведение совместных операций с армией на материке. Боеспособными кораблями отряда являлись только канонерская лодка «Вотяк», пароходы «Смелый» и «Михаил», которые в весенне-осенний период несли боевую службу в нижнем течении Амура, а с октября по май зимовали в Мариинском (их команда, за исключением караула, на это время через Николаевск убывала на Сахалин). В связи с выводом японской армии из Нижнего Приамурья осенью 1922 г. пункт базирования в Мариинском был расформирован, а находившиеся там корабли эвакуированы на Северный Сахалин. Мониторы «Шквал», «Монгол» и «Бурят» вплоть до мая 1925 г. стояли в эллинге в Александровске-Сахалинском и в операциях отряда не участвовали. После восстановления советско-японских дипломатических отношений специальный отряд охраны водного района вернулся из Александровска в метрополию, а все ранее захваченные корабли были возвращены СССР[551].
В решении задач отряд тесно взаимодействовал с 3-й эскадрой миноносных сил, которая в 1920–1922 гг. систематически направляла свои боевые корабли в Де-Кастри и Николаевск-на-Амуре для обеспечения контроля японской армии за Нижним Приамурьем. К середине мая силы эскадры заканчивали подготовку в своих пунктах базирования, затем совершали переход в Александровск-Сахалинский, откуда убывали в Де-Кастри и Николаевск-на-Амуре. В конце сентября корабельная группировка 3-й эскадры завершала боевую службу и возвращалась в Японию.
Наряд её сил, как правило, был стандартным – 1 крейсер, 1 канонерская лодка и 2 дивизиона эсминцев (по 4 вымпела каждый). Так, в 1920 г. приказом командующего 3-м флотом в Де-Кастри и Николаевск-на-Амуре были направлены уже нёсшие там в прошлом году службу крейсер 2-го класса «Цусима» (флагман), канонерская лодка «Тихая», 7-й и 31-й дивизионы эсминцев. В 1921 г. в нижнем течении Амура, акватории Татарского пролива и Амурского лимана оперировали крейсер 2-го класса «Хирато» (флагман), канонерская лодка «Могами», 6-й и 31-й дивизионы эсминцев, а также перешедшие в оперативное подчинение командира 3-й эскадры канонерка «Вотяк» и пароход «Сильный». Однако в 1922 г. на театре находились только канонерская лодка «Тихая» и 6-й дивизион эсминцев, которые в связи с расформированием 3-й эскадры были оперативно подчинены командиру специального отряда охраны водного района[552].
Разведывательная деятельность отряда и эскадры в 1920–1922 гг. ограничивалась докладами командиров оперировавших в устье Амура боевых кораблей, опросами переходивших на Сахалин в зимний период по льду Татарского пролива русских и японских граждан, отправкой на транспортных судах офицеров на материк или инспекционными поездками комсостава. Большой объём сведений поступал от разведорганов Сахалинской экспедиционной армии и военной жандармерии. Информацию об Амурской речной флотилии, особенно о её пункте базирования в Благовещенске, командование 3-й эскадры получало от ЯВМ Владивостокской экспедиционной армии[553].
После вывода японских войск в дополнение к уже использовавшимся методам сбора информации офицеры отряда стали проводить регулярный опрос членов экипажей торговых судов, курсировавших между Николаевском-на-Амуре и Северным Сахалином. Ценным источником сведений об обстановке на материке до Хабаровска включительно для отряда и эскадры был остававшийся в 1920–1925 гг. в Николаевске предприниматель Симада Мототаро[554]. Штатной должности начальника разведки в отряде и эскадре не было, поэтому обязанности по сбору и обработке информации выполнял один из офицеров штаба.