После Февральской революции значение военных священников стало катастрофически падать. В немалой степени на это повлияла опубликованная резолюция Всероссийского съезда военного и морского духовенства, состоявшегося в 1917 году. В ней было записано: «Съезд постановил единодушно приветствовать совершившийся государственный переворот как исторический момент исключительной важности, открывший перед русским народом светлые перспективы обновлённой политики и церковно-общественной жизни, построенной на евангельских началах свободы, любви, равенства, братства… Служители Церкви, проповедующие вечные истины, должны стоять выше изменяющейся политики и каких-либо партий, но, будучи в то же время гражданами, призванными в данный момент осуществить свои гражданские права, священноцерковнослужители могут присоединяться к политическим партиям и поддержать (например, в Учредительном Собрании) тех представителей, которые борются за проведение в жизнь христианских начал и идей народовластия».
Последующие события показали, что принятие революции не спасло ни страну, ни военное духовенство от тяжёлых испытаний и неисчислимых жертв. Тяжкая участь постигла бо́льшую часть военных священников.
Власть, установившаяся в результате большевистского переворота, была основана на атеистической идеологии. Неудивительно, что борьба с «пережитками прошлого», включая религиозное мировоззрение, началась сразу же после революции. В первую очередь «рассадник мракобесия» необходимо было искоренить в армии, от которой зависит прочность любой власти.
Однако отношение к священникам в армейской среде стало заметно ухудшаться ещё в последние имперские месяцы и в особенности после Февральской революции.
С одной стороны, Временное правительство сохраняло военное духовенство и желало продолжения войны до победного конца, а с другой – вводило гибельные для армии демократические формы и финансировало агитаторов, которые призывали солдат возвращаться в свои деревни, чтобы поделить помещичьи земли. Таким образом, при официальной поддержке духовенства в первые месяцы новой революционной власти постепенно начинались притеснения, которые вскоре превратились в гонения.
Приказ Петроградского Совета рабочих и солдатских депутатов № 1 привёл к ускоренному развалу армии. И соответственно к уничтожению сообщества военного духовенства.
Был распущен старый состав Святейшего Правительствующего Синода. Временное правительство отстранило двенадцать архиереев, которые подозревались в нелояльности новой власти. Фактически во всех епархиях власть передавалась от архиереев к церковно-епархиальным советам, что являлось грубым нарушением канонического права. В 1917 году в России было три митрополита, однако ни один из них не был допущен в новый состав Синода. Вместе с тем в угоду «демократическим» веяниям Временное правительство ввело в его состав четырёх священников. Это являлось прямым нарушением церковной дисциплины. Как подчеркивает исследователь Д. Соколов, «эти действия правительства грубо нарушали церковные каноны». А это для Церкви является серьёзными нарушениями. И они не остаются без последствий.
Второй Всероссийский съезд военного и морского духовенства, собравшийся в Могилёве в июле 1917 года, попытался привести свою деятельность в соответствие со сложившимися условиями. Было принято решение о допустимости участия духовенства в политических процессах в стране и о введении принципа выборности. Однако, по выражению отца Георгия Шавельского, «никакими эффектами и никакими талантами духовных лиц уже нельзя было остановить охватившего армию безумия, принявшего характер стихийной силы. Общефронтовой съезд 1917 г. военного и морского духовенства был его последней, лебединой песней».
В 1917 году массовым явлением стало дезертирство, началось братание с врагом. Решать, идти или не идти в наступление, стали полковые комитеты. Последовали аресты и убийства офицеров. Священников тоже арестовывали по любому поводу. Например, священник Николай Вешкельский был обвинён в монархической пропаганде и арестован только за то, что по недосмотру раздал солдатам молитвы пророку Илии, где упоминалось имя императора.
Военным пастырям, учившим идти в бой «за Веру, Царя и Отечество», после Февральского переворота трудно было объяснить, за что воюют солдаты. При этом для пастырей невозможно было проповедовать идеи, которые были популярны среди солдат, приветствовать братание с врагом и дезертирство. Такая позиция пастырей приводила к росту озлобленности в войсках. Начались оскорбления и прямые угрозы в адрес духовенства. В резолюции Совета депутатов 2-й Латышской стрелковой бригады было записано: «Трёх святых воронов-дармоедов необходимо в течение трёх дней выселить из бригады».