В воздухе центрального поста образовалась туманная дымка. На палубе было битое стекло от плафонов и приборов, аварийный инструмент силой взрыва был сброшен со своих мест. Вышли из строя глубиномеры. Подводная лодка легла на грунт. Глубина моря по карте – около 50 метров. Было отдано приказание: «Осмотреться в отсеках». Отсеки доложили, что поступления воды не обнаружено. Но повторный осмотр в отсеках показал, что обе группы аккумуляторных батарей имеют полный корпус, что означало повреждение баков элементов аккумуляторной батареи. По прошествии часа командир приказал всплывать. Так как глубиномеры вышли из строя, решили всплывать медленно, путем откачки воды из уравнительной цистерны. При всплытии обнаружили, что рулевые указатели вертикального руля и кормовых горизонтальных рулей вышли из строя.
О перекладке вертикального руля докладывал седьмой отсек по механическому указателю, а управление по глубине стали производить носовыми горизонтальными рулями. Через несколько минут подняли зенитный перископ и командир стал наблюдать за всплытием. Дали ход электромоторами. При включении вентиляторов охлаждения главных моторов было обнаружено, что вал вентилятора главного мотора правого борта заклинен. Командир сообщил, что освещенность воды в перископе быстро растет, поэтому в уравнительную цистерну была принята вода, носовые рули были положены на погружение. Подводная лодка медленно всплыла на перископную глубину. В перископ командир увидел два самолета МБР-2, поэтому было приказано сигнальщику взять ракетницу для обмена опознавательными с самолетами. Продув среднюю группу цистерн главного балласта, подводная лодка всплыла в позиционное положение.
По команде приготовиться продувать главный балласт доложили, что циркуляционная помпа охлаждения правого дизеля не проворачивается, фонарь помпы имеет трещины, помпа охлаждения левого двигателя проворачивается. С неисправной помпой левый дизель был пущен на продувание главного балласта. С мостика сообщили, что вокруг лодки на большом радиусе плавает соляровое масло. После продувания главного балласта было принято решение: тросами стянуть фонарь помпы охлаждения правого дизеля для возможности иметь ход.
Командир собрал офицеров и выслушал доклады о повреждениях. К этому времени выяснилось, что у вдувного и вытяжного общесудовых вентиляторов заклинило крылатки и вентилировать аккумуляторную батарею невозможно, а сточные колодцы аккумуляторных ям заполнены электролитом. На основании всех докладов командир принял решение возвратиться в Архангельск, о чем запросил штаб Беломорской флотилии. После работ с циркуляционной помпой охлаждения левого дизеля был дан ход левым дизелем, и подводная лодка легла на курс в Архангельск.
По пути нас встретил миноносец, на борту которого находился командир дивизиона подводных лодок, переходящих с Балтийского моря, а затем морской буксир. Нам была предложена помощь по буксировке, но командир принял решение следовать своим ходом, а на всякий случай буксиру быть в кильватере.
По возвращении в Архангельск специально назначенной комиссией был произведен тщательный осмотр материальной части подводной лодки. В результате осмотра было установлено, что на лодку необходимо немедленно подать питание электроэнергии с берега, аккумуляторную батарею отключить и немедленно приступить к выгрузке, так как большинство баков имеют трещины, а ряд элементов уже сухие (электролит уже вытек через трещины, а это могло вызвать возгорание). Все вентиляторы и циркуляционные насосы требуют ремонта, некоторые штоки клапанов вентиляции цистерн главного балласта погнуты и не закрываются. Большинство труб вентиляции цистерн главного балласта вогнуты вовнутрь и требуют замены или правки. Несколько заклепок прочного корпуса дали течь.
Комиссия решила, что в таком состоянии С-101 перейти в Полярное не может. Необходимо на берегу построить сарай для выполнения всех работ с аккумуляторной батареей, лодку поставить в док и произвести ремонт механизмов. Выполнение работ было поручено Соломбальским ремонтно-механическим мастерским и заводу «Красная кузница».