По Кампоформийскому мирному договору, подписанному 17 октября, было согласовано, что Австрия, которая уже получила во владение Далмацию, получит еще и город Венецию. В нарушение собственных обязательств, Бонапарт сразу приказал разрушить все венецианские военные корабли, которые невозможно увести. Согласно этому приказу, французы уничтожили или потопили корабль «Витториа» 70 и еще 10 линкоров, «Беллона» 40, еще 6 фрегатов и почти все малые суда. Не пощадили даже «Бучинторо», церемониальную галеру дожа. С другой стороны, французы завершили постройку нескольких кораблей, которые обнаружили на верфях. Два фрегата, «Муирон» 40 и «Каррер» 40, вышли из Арсенала 2 ноября, 2 линкора – «Лахарп» 74 и «Стенгель» 64 – 17-го, а третий, «Бейран» 64, – 18-го. Все они были отправлены в Анкону.
Флот под командованием Бруе вышел из Венеции в конце сентября и после захода в Гравозу и Рагузу ушел к Корфу. В это время великой целью Франции был сбор всех возможных кораблей в Бресте, чтобы прикрывать вторжение в Англию – единственного врага, пока еще не побежденного. Бруе получил приказ идти туда со своим флотом и всеми доступными венецианскими судами, однако нехватка людей, запасов и средств не позволила ему выполнить приказ. В конце года (10 января 1798 года по новому стилю) французские корабли в Адриатике и вокруг нее располагались следующим образом9.
На Корфу: «Гийом Телль» и «Тоннан» – 84-пушечники, «Женерё», «Эрё», «Аквилон», «Меркурий» – 74-пушечники, «Сибел» 12 – с бывшими венецианскими судами «Дюбуа» (прежнее название – «Фама»), «Коссе» (бывший «Вулкано»), «Банель» (бывшая «Глория»), «Робер» (бывший «Эоло»), «Сандос» (бывший «С. Джорджио») и «Фронтен» (бывшая «Медея») – 64-пушечники. А также «Леобен» (бывшая «Медуза») и «Донато» (бывшая «Пальма») – 40-пушечники, «Монтенот» (бывший «Брилланте») – 30-пушечник.
В Анконе: «Диана» и «Юнона» – 40-пушечники, «Мерой» и «Серф» – 12-пушечники, с бывшим венецианцем «Лахарп» 74, «Стенгель» и «Бейран» – 64-пушечники, «Муирон» и «Каррер» – 40-пушечники.
В море: «Юстис» и «Артемис» – 40-пушечники, «Мантуя» (бывшая «Церера») 32, «Инфант» 18, «Риволи» (бывший «Кастор») 16, «Мондови» 16, «Алерт» 14. «Брун» 30 находился в Смирне, а «Сенсибль» 40 и «Лоди» (бывший «Джиасон») 18 – на пути в Тулон, куда они прибыли в начале февраля.
Путешествие в Брест было невозможно, но длительное пребывание на Адриатике – немногим лучше. Поэтому 24 февраля 1798 года Бруе выбрал единственный открытый для него путь и на собственный страх и риск отправился в Тулон. Он взял с собой весь флот, за исключением кораблей «Сандос» 64, «Лонато» 40, «Риволи» 16, «Мондови» 16, «Сибел» 12 и 16 малых судов – они остались на Корфу. «Лахарп» 74, «Стенгель» 64 и «Бейран» 64, «Алерт» 14, «Мероп» 12 и «Серф» 12 остались в Анконе. В Тулон корабли прибыли 2 апреля.
По пути он задумал нанести внезапный удар по Мальте – во исполнение одной из схем Бонапарта. Один из его кораблей, «Фронтен» 64, был отправлен в порт для устранения течи, реальной или вымышленной, а на нем было два мальтийца, находившиеся на французской службе, которые должны были связаться с берегом и выяснить, может ли внезапное нападение стать удачным. Бруе крейсировал вокруг острова с остальным флотом, поддерживая постоянную связь с кораблем-ла-зутчиком, но сообщения с Мальты поступали неутешительные.
Поэтому 10 марта, после недельной задержки, Бруе отказался от своего плана и продолжил плавание в Тулон.
Тем временем от великого плана вторжения в Англию Бонапарт отказался ради нападения на Египет. Он лично провел инспекционную поездку по берегам Франции и Голландии и решил, что предполагаемое вторжение почти невозможно. Спустя девять дней Талейран передал ему план экспедиции в Египет, и эта же самая идея была высказана Бонапартом в качестве возможной альтернативы нападения на Англию. Окончательное решение было принято после получения донесения Дессе о том, что флот в Бресте не готов к серьезным действиям. Соответственно, 5 марта 1798 года были изданы приказы, сделавшие египетскую экспедицию главной целью французов.