Великий полководец во главе русско-австрийского войска быстро очистил большую часть Северной Италии от французских войск. После этого союз с Австрией начал давать сбои, так как их цель – вернуть себе власть в Северной Италии – была достигнута. Но Суворов не получал приказ останавливаться на достигнутом, да и французская армия стягивала силы. Суворов не дал соединиться генералам Моро и Макдональду, стремительным маршем перегородив дорогу последнему. В битве при Тидоне французские войска были разгромлены и отступили к реке Требии. Там состоялось еще одно сражение, закончившееся поражением французских войск. Моро на выручку так и не пришел, так как его блокировали войска Суворова. Бонапарт прислал на подмогу своим частям в Италии отряд молодого генерала Жубера, который дал отряду Суворова генеральное сражение около города Нови, но проиграл и был убит.
Италия была полностью освобождена от французских войск. Австрийцы, обеспокоенные как победой русских в Италии, так и бедственным положением войска в Швейцарии, предложили А.В. Суворову совершить переход через Альпы и прийти на помощь союзникам. Сбивая авангарды неприятеля, овладев перевалом Сен-Готард, русская армия перешла через Альты. Одним из наиболее трудных мест был так называемый Чертов мост над пропастью. Французы разрушили его и взяли под прицел переправу. Суворов послал по горным кручам отряд Багратиона, который обрушился на французов с тыла. После чего русские солдаты связали бревна и перешли по ним перевал.
В Мутеннской долине русскую армию ждала французская армия во главе с генералом Массена. И измученная переходом армия Суворова победила! Австрийская же армия не присоединилась к ним, более того, они срывали поставки продовольствия и снабжения оружием, о чем существовала договоренность между императорами. Император Павел был возмущен подобным поведением союзников, тем более что в войсках Суворова находился великий князь Константин Павлович.
Австрийцы стали действовать самостоятельно. В итальянском городе Анкона, взятом русскими войсками, был спущен российский флаг и поднят австрийский. Такое несоюзническое поведение австрийцев стало для императора Павла I последней каплей.
За блестящие победы, как известно, А.С. Суворов получил звание генералиссимуса, титул князя Италийского, а великий князь Константин стал называться цесаревичем.
В конце 1799 г. русская армия получила приказ императора Павла I прекратить совместные действия с Австрией и возвращаться в Россию. Несмотря на блестящие победы русской армии, этот поход показал все усиливающееся отставание русских войск от западных союзников. Это проявилось в системе комплектования и организации войск. Те реформы в армии, которые провел император Павел, не способствовали немедленному увеличению ее мощи, скорее наоборот. Отказ от дивизионного формирования, отсутствие хорошо подготовленных штабных офицеров привели к тому, что русская армия оказалась в зависимости от австрийского штаба. Еще более негативно сказалось отсутствие подготовленных резервов. Однако все это не было заметно императору Павлу I. В то же время очевидно было невыполнение союзнических обязательств Австрией и особенно Англией.
Английское правительство использовало победы на море и захват островов прежде всего в собственных торговых интересах. Главенство английского флота в Средиземном море сковывало торговлю других стран. 25 августа (5 сентября) 1800 г. английский флот захватил остров Мальту, как известно пользующуюся особым покровительством Павла I. Узнав об этом, император Павел заявил о разрыве всех дипломатических отношений с Англией.
В это время Наполеон, ставший 18 брюмера (9 ноября) 1799 г. французским первым консулом и начавший наводить столь близкий сердцу Павла I порядок в стране, совершил акт доброй воли, желая задобрить российского императора. Он объявил, что без всякого обмена он возвращает всех русских пленных, находящихся на территории Франции. Наполеону нужен был союз с Россией против Англии. Вопрос – нужен ли был этот союз России, с политической и экономической точек зрения, остается открытым.
Интерес к противостоянию России и Англии в конце правления императора Павла I важен еще и тем, что ряд современных авторов напрямую пишут, что причиной, движущей силой заговора и цареубийства, была Англия, которая была инициатором и финансистом устранения императора Павла I. Об этом пишет опубликовавший документы эпохи Павла Петровича В.А. Томсинов, который считает, что организация заговора и цареубийства – прямое следствие организации индийского похода.